Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GNEQ9Y223 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GNEQ9Y223 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GNEQ9Y223 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GNEQ9Y223 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GNEQ9Y223 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GNEQ9Y223 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GNEQ9Y223 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GNEQ9Y223 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GNEQ9Y223 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GNEQ9Y223 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GNEQ9Y223 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GNEQ9Y223 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GNEQ9Y223 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GNEQ9Y223 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GNEQ9Y223 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GNEQ9Y223 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GNEQ9Y223 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GNEQ9Y223 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
GNEQ9Y223 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GNEQ9Y223 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GNEQ9Y223 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GNEQ9Y223 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GNEQ9Y223 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GNEQ9Y223 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GNEQ9Y223 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
GNEQ9Y223 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GNEQ9Y223 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GNEQ9Y223 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GNEQ9Y223 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GNEQ9Y223 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GNEQ9Y223 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GNEQ9Y223 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GNEQ9Y223 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GNEQ9Y223 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GNEQ9Y223 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GNEQ9Y223 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GNEQ9Y223 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GNEQ9Y223 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GNEQ9Y223 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GNEQ9Y223 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GNEQ9Y223 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GNEQ9Y223 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GNEQ9Y223 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GNEQ9Y223 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GNEQ9Y223 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GNEQ9Y223 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GNEQ9Y223 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GNEQ9Y223 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GNEQ9Y223 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GNEQ9Y223 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GNEQ9Y223 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GNEQ9Y223 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GNEQ9Y223 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GNEQ9Y223 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GNEQ9Y223 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GNEQ9Y223 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GNEQ9Y223 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GNEQ9Y223 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GNEQ9Y223 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GNEQ9Y223 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GNEQ9Y223 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GNEQ9Y223 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GNEQ9Y223 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GNEQ9Y223 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GNEQ9Y223 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GNEQ9Y223 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GNEQ9Y223 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GNEQ9Y223 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GNEQ9Y223 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GNEQ9Y223 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GNEQ9Y223 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GNEQ9Y223 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GNEQ9Y223 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GNEQ9Y223 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GNEQ9Y223 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GNEQ9Y223 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GNEQ9Y223 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GNEQ9Y223 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GNEQ9Y223 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GNEQ9Y223 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GNEQ9Y223 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GNEQ9Y223 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GNEQ9Y223 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GNEQ9Y223 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GNEQ9Y223 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GNEQ9Y223 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GNEQ9Y223 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GNEQ9Y223 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GNEQ9Y223 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GNEQ9Y223 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GNEQ9Y223 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GNEQ9Y223 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.56■■■□□ 2
GNEQ9Y223 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GNEQ9Y223 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GNEQ9Y223 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
GNEQ9Y223 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
GNEQ9Y223 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
GNEQ9Y223 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GNEQ9Y223 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms