Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERVW-1Q9UQF0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVW-1Q9UQF0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVW-1Q9UQF0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVW-1Q9UQF0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVW-1Q9UQF0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERVW-1Q9UQF0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVW-1Q9UQF0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVW-1Q9UQF0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVW-1Q9UQF0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVW-1Q9UQF0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVW-1Q9UQF0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ERVW-1Q9UQF0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVW-1Q9UQF0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVW-1Q9UQF0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVW-1Q9UQF0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVW-1Q9UQF0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVW-1Q9UQF0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVW-1Q9UQF0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVW-1Q9UQF0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVW-1Q9UQF0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ERVW-1Q9UQF0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVW-1Q9UQF0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVW-1Q9UQF0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVW-1Q9UQF0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVW-1Q9UQF0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVW-1Q9UQF0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVW-1Q9UQF0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVW-1Q9UQF0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVW-1Q9UQF0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVW-1Q9UQF0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ERVW-1Q9UQF0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERVW-1Q9UQF0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERVW-1Q9UQF0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ERVW-1Q9UQF0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVW-1Q9UQF0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVW-1Q9UQF0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVW-1Q9UQF0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVW-1Q9UQF0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ERVW-1Q9UQF0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVW-1Q9UQF0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVW-1Q9UQF0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVW-1Q9UQF0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ERVW-1Q9UQF0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVW-1Q9UQF0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVW-1Q9UQF0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVW-1Q9UQF0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ERVW-1Q9UQF0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVW-1Q9UQF0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVW-1Q9UQF0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVW-1Q9UQF0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVW-1Q9UQF0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVW-1Q9UQF0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVW-1Q9UQF0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVW-1Q9UQF0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ERVW-1Q9UQF0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ERVW-1Q9UQF0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVW-1Q9UQF0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVW-1Q9UQF0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVW-1Q9UQF0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVW-1Q9UQF0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVW-1Q9UQF0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVW-1Q9UQF0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVW-1Q9UQF0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ERVW-1Q9UQF0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVW-1Q9UQF0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVW-1Q9UQF0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVW-1Q9UQF0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVW-1Q9UQF0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVW-1Q9UQF0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVW-1Q9UQF0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVW-1Q9UQF0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVW-1Q9UQF0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ERVW-1Q9UQF0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVW-1Q9UQF0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVW-1Q9UQF0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ERVW-1Q9UQF0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVW-1Q9UQF0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVW-1Q9UQF0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVW-1Q9UQF0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ERVW-1Q9UQF0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVW-1Q9UQF0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ERVW-1Q9UQF0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVW-1Q9UQF0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVW-1Q9UQF0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVW-1Q9UQF0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVW-1Q9UQF0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVW-1Q9UQF0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVW-1Q9UQF0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ERVW-1Q9UQF0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERVW-1Q9UQF0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERVW-1Q9UQF0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ERVW-1Q9UQF0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVW-1Q9UQF0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVW-1Q9UQF0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ERVW-1Q9UQF0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVW-1Q9UQF0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ERVW-1Q9UQF0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms