Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MAPRE3Q9UPY8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MAPRE3Q9UPY8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAPRE3Q9UPY8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAPRE3Q9UPY8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAPRE3Q9UPY8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAPRE3Q9UPY8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAPRE3Q9UPY8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAPRE3Q9UPY8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MAPRE3Q9UPY8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAPRE3Q9UPY8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAPRE3Q9UPY8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAPRE3Q9UPY8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MAPRE3Q9UPY8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAPRE3Q9UPY8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAPRE3Q9UPY8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MAPRE3Q9UPY8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAPRE3Q9UPY8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAPRE3Q9UPY8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAPRE3Q9UPY8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAPRE3Q9UPY8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAPRE3Q9UPY8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAPRE3Q9UPY8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAPRE3Q9UPY8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MAPRE3Q9UPY8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAPRE3Q9UPY8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAPRE3Q9UPY8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAPRE3Q9UPY8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAPRE3Q9UPY8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MAPRE3Q9UPY8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MAPRE3Q9UPY8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAPRE3Q9UPY8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAPRE3Q9UPY8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAPRE3Q9UPY8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAPRE3Q9UPY8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MAPRE3Q9UPY8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAPRE3Q9UPY8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAPRE3Q9UPY8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAPRE3Q9UPY8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MAPRE3Q9UPY8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAPRE3Q9UPY8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAPRE3Q9UPY8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MAPRE3Q9UPY8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MAPRE3Q9UPY8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAPRE3Q9UPY8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAPRE3Q9UPY8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAPRE3Q9UPY8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MAPRE3Q9UPY8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAPRE3Q9UPY8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAPRE3Q9UPY8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAPRE3Q9UPY8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MAPRE3Q9UPY8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAPRE3Q9UPY8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAPRE3Q9UPY8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAPRE3Q9UPY8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAPRE3Q9UPY8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MAPRE3Q9UPY8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAPRE3Q9UPY8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MAPRE3Q9UPY8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MAPRE3Q9UPY8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAPRE3Q9UPY8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAPRE3Q9UPY8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAPRE3Q9UPY8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAPRE3Q9UPY8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAPRE3Q9UPY8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MAPRE3Q9UPY8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 584.2 ms