Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AGTPBP1Q9UPW5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AGTPBP1Q9UPW5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
AGTPBP1Q9UPW5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
AGTPBP1Q9UPW5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
AGTPBP1Q9UPW5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
AGTPBP1Q9UPW5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
AGTPBP1Q9UPW5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AGTPBP1Q9UPW5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AGTPBP1Q9UPW5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AGTPBP1Q9UPW5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
AGTPBP1Q9UPW5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
AGTPBP1Q9UPW5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
AGTPBP1Q9UPW5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
AGTPBP1Q9UPW5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
AGTPBP1Q9UPW5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AGTPBP1Q9UPW5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
AGTPBP1Q9UPW5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AGTPBP1Q9UPW5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AGTPBP1Q9UPW5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
AGTPBP1Q9UPW5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AGTPBP1Q9UPW5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
AGTPBP1Q9UPW5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
AGTPBP1Q9UPW5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AGTPBP1Q9UPW5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
AGTPBP1Q9UPW5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
AGTPBP1Q9UPW5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
AGTPBP1Q9UPW5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
AGTPBP1Q9UPW5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
AGTPBP1Q9UPW5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
AGTPBP1Q9UPW5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
AGTPBP1Q9UPW5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
AGTPBP1Q9UPW5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
AGTPBP1Q9UPW5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
AGTPBP1Q9UPW5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AGTPBP1Q9UPW5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
AGTPBP1Q9UPW5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
AGTPBP1Q9UPW5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
AGTPBP1Q9UPW5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AGTPBP1Q9UPW5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
AGTPBP1Q9UPW5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
AGTPBP1Q9UPW5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
AGTPBP1Q9UPW5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
AGTPBP1Q9UPW5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
AGTPBP1Q9UPW5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
AGTPBP1Q9UPW5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
AGTPBP1Q9UPW5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
AGTPBP1Q9UPW5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
AGTPBP1Q9UPW5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AGTPBP1Q9UPW5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AGTPBP1Q9UPW5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
AGTPBP1Q9UPW5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
AGTPBP1Q9UPW5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
AGTPBP1Q9UPW5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
AGTPBP1Q9UPW5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
AGTPBP1Q9UPW5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
AGTPBP1Q9UPW5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
AGTPBP1Q9UPW5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
AGTPBP1Q9UPW5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
AGTPBP1Q9UPW5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
AGTPBP1Q9UPW5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
AGTPBP1Q9UPW5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
AGTPBP1Q9UPW5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
AGTPBP1Q9UPW5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AGTPBP1Q9UPW5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AGTPBP1Q9UPW5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AGTPBP1Q9UPW5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AGTPBP1Q9UPW5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
AGTPBP1Q9UPW5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
AGTPBP1Q9UPW5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
AGTPBP1Q9UPW5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AGTPBP1Q9UPW5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
AGTPBP1Q9UPW5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
AGTPBP1Q9UPW5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
AGTPBP1Q9UPW5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AGTPBP1Q9UPW5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AGTPBP1Q9UPW5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AGTPBP1Q9UPW5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AGTPBP1Q9UPW5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
AGTPBP1Q9UPW5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
AGTPBP1Q9UPW5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
AGTPBP1Q9UPW5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
AGTPBP1Q9UPW5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
AGTPBP1Q9UPW5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
AGTPBP1Q9UPW5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
AGTPBP1Q9UPW5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
AGTPBP1Q9UPW5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
AGTPBP1Q9UPW5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
AGTPBP1Q9UPW5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
AGTPBP1Q9UPW5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
AGTPBP1Q9UPW5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
AGTPBP1Q9UPW5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
AGTPBP1Q9UPW5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
AGTPBP1Q9UPW5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms