Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
AGAP1Q9UPQ3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
AGAP1Q9UPQ3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AGAP1Q9UPQ3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AGAP1Q9UPQ3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AGAP1Q9UPQ3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
AGAP1Q9UPQ3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AGAP1Q9UPQ3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AGAP1Q9UPQ3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AGAP1Q9UPQ3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AGAP1Q9UPQ3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AGAP1Q9UPQ3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AGAP1Q9UPQ3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AGAP1Q9UPQ3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AGAP1Q9UPQ3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AGAP1Q9UPQ3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AGAP1Q9UPQ3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AGAP1Q9UPQ3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AGAP1Q9UPQ3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AGAP1Q9UPQ3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
AGAP1Q9UPQ3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AGAP1Q9UPQ3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
AGAP1Q9UPQ3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AGAP1Q9UPQ3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AGAP1Q9UPQ3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AGAP1Q9UPQ3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AGAP1Q9UPQ3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AGAP1Q9UPQ3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AGAP1Q9UPQ3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AGAP1Q9UPQ3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AGAP1Q9UPQ3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AGAP1Q9UPQ3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AGAP1Q9UPQ3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
AGAP1Q9UPQ3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AGAP1Q9UPQ3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AGAP1Q9UPQ3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms