Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TPCN1Q9ULQ1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TPCN1Q9ULQ1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TPCN1Q9ULQ1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TPCN1Q9ULQ1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TPCN1Q9ULQ1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TPCN1Q9ULQ1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TPCN1Q9ULQ1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TPCN1Q9ULQ1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TPCN1Q9ULQ1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TPCN1Q9ULQ1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TPCN1Q9ULQ1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TPCN1Q9ULQ1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TPCN1Q9ULQ1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TPCN1Q9ULQ1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TPCN1Q9ULQ1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TPCN1Q9ULQ1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TPCN1Q9ULQ1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TPCN1Q9ULQ1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TPCN1Q9ULQ1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TPCN1Q9ULQ1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TPCN1Q9ULQ1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TPCN1Q9ULQ1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TPCN1Q9ULQ1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TPCN1Q9ULQ1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TPCN1Q9ULQ1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TPCN1Q9ULQ1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TPCN1Q9ULQ1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TPCN1Q9ULQ1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TPCN1Q9ULQ1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TPCN1Q9ULQ1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TPCN1Q9ULQ1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TPCN1Q9ULQ1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TPCN1Q9ULQ1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TPCN1Q9ULQ1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TPCN1Q9ULQ1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TPCN1Q9ULQ1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TPCN1Q9ULQ1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TPCN1Q9ULQ1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TPCN1Q9ULQ1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TPCN1Q9ULQ1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TPCN1Q9ULQ1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TPCN1Q9ULQ1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TPCN1Q9ULQ1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TPCN1Q9ULQ1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TPCN1Q9ULQ1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TPCN1Q9ULQ1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TPCN1Q9ULQ1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TPCN1Q9ULQ1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TPCN1Q9ULQ1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TPCN1Q9ULQ1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TPCN1Q9ULQ1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TPCN1Q9ULQ1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TPCN1Q9ULQ1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TPCN1Q9ULQ1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TPCN1Q9ULQ1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TPCN1Q9ULQ1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TPCN1Q9ULQ1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TPCN1Q9ULQ1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TPCN1Q9ULQ1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TPCN1Q9ULQ1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TPCN1Q9ULQ1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TPCN1Q9ULQ1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TPCN1Q9ULQ1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TPCN1Q9ULQ1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TPCN1Q9ULQ1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TPCN1Q9ULQ1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TPCN1Q9ULQ1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TPCN1Q9ULQ1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TPCN1Q9ULQ1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TPCN1Q9ULQ1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TPCN1Q9ULQ1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TPCN1Q9ULQ1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TPCN1Q9ULQ1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TPCN1Q9ULQ1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TPCN1Q9ULQ1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TPCN1Q9ULQ1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TPCN1Q9ULQ1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TPCN1Q9ULQ1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TPCN1Q9ULQ1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TPCN1Q9ULQ1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TPCN1Q9ULQ1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TPCN1Q9ULQ1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TPCN1Q9ULQ1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TPCN1Q9ULQ1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TPCN1Q9ULQ1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TPCN1Q9ULQ1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TPCN1Q9ULQ1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TPCN1Q9ULQ1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TPCN1Q9ULQ1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TPCN1Q9ULQ1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TPCN1Q9ULQ1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TPCN1Q9ULQ1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TPCN1Q9ULQ1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TPCN1Q9ULQ1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TPCN1Q9ULQ1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TPCN1Q9ULQ1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TPCN1Q9ULQ1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TPCN1Q9ULQ1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TPCN1Q9ULQ1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
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