Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA9

PTBP2, Polypyrimidine tract-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP2Q9UKA9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTBP2Q9UKA9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTBP2Q9UKA9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTBP2Q9UKA9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTBP2Q9UKA9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTBP2Q9UKA9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTBP2Q9UKA9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTBP2Q9UKA9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTBP2Q9UKA9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTBP2Q9UKA9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTBP2Q9UKA9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTBP2Q9UKA9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTBP2Q9UKA9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTBP2Q9UKA9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTBP2Q9UKA9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PTBP2Q9UKA9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PTBP2Q9UKA9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTBP2Q9UKA9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PTBP2Q9UKA9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTBP2Q9UKA9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PTBP2Q9UKA9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTBP2Q9UKA9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTBP2Q9UKA9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTBP2Q9UKA9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTBP2Q9UKA9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTBP2Q9UKA9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTBP2Q9UKA9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTBP2Q9UKA9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTBP2Q9UKA9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTBP2Q9UKA9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTBP2Q9UKA9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTBP2Q9UKA9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTBP2Q9UKA9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTBP2Q9UKA9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTBP2Q9UKA9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTBP2Q9UKA9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTBP2Q9UKA9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTBP2Q9UKA9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTBP2Q9UKA9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTBP2Q9UKA9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTBP2Q9UKA9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTBP2Q9UKA9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTBP2Q9UKA9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTBP2Q9UKA9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTBP2Q9UKA9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTBP2Q9UKA9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTBP2Q9UKA9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTBP2Q9UKA9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTBP2Q9UKA9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTBP2Q9UKA9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTBP2Q9UKA9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTBP2Q9UKA9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTBP2Q9UKA9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTBP2Q9UKA9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTBP2Q9UKA9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms