Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLCO3A1Q9UIG8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLCO3A1Q9UIG8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLCO3A1Q9UIG8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLCO3A1Q9UIG8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLCO3A1Q9UIG8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLCO3A1Q9UIG8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLCO3A1Q9UIG8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLCO3A1Q9UIG8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLCO3A1Q9UIG8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLCO3A1Q9UIG8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLCO3A1Q9UIG8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLCO3A1Q9UIG8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLCO3A1Q9UIG8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLCO3A1Q9UIG8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLCO3A1Q9UIG8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLCO3A1Q9UIG8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLCO3A1Q9UIG8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLCO3A1Q9UIG8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLCO3A1Q9UIG8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLCO3A1Q9UIG8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLCO3A1Q9UIG8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLCO3A1Q9UIG8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLCO3A1Q9UIG8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLCO3A1Q9UIG8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLCO3A1Q9UIG8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLCO3A1Q9UIG8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLCO3A1Q9UIG8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLCO3A1Q9UIG8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLCO3A1Q9UIG8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLCO3A1Q9UIG8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLCO3A1Q9UIG8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLCO3A1Q9UIG8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLCO3A1Q9UIG8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLCO3A1Q9UIG8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLCO3A1Q9UIG8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SLCO3A1Q9UIG8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLCO3A1Q9UIG8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLCO3A1Q9UIG8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLCO3A1Q9UIG8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLCO3A1Q9UIG8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLCO3A1Q9UIG8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLCO3A1Q9UIG8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLCO3A1Q9UIG8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLCO3A1Q9UIG8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLCO3A1Q9UIG8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLCO3A1Q9UIG8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLCO3A1Q9UIG8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLCO3A1Q9UIG8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLCO3A1Q9UIG8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLCO3A1Q9UIG8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLCO3A1Q9UIG8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLCO3A1Q9UIG8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLCO3A1Q9UIG8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLCO3A1Q9UIG8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLCO3A1Q9UIG8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLCO3A1Q9UIG8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLCO3A1Q9UIG8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLCO3A1Q9UIG8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLCO3A1Q9UIG8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLCO3A1Q9UIG8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLCO3A1Q9UIG8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLCO3A1Q9UIG8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLCO3A1Q9UIG8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLCO3A1Q9UIG8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SLCO3A1Q9UIG8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLCO3A1Q9UIG8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLCO3A1Q9UIG8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLCO3A1Q9UIG8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLCO3A1Q9UIG8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLCO3A1Q9UIG8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLCO3A1Q9UIG8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLCO3A1Q9UIG8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLCO3A1Q9UIG8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLCO3A1Q9UIG8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLCO3A1Q9UIG8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLCO3A1Q9UIG8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLCO3A1Q9UIG8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLCO3A1Q9UIG8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLCO3A1Q9UIG8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLCO3A1Q9UIG8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLCO3A1Q9UIG8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLCO3A1Q9UIG8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLCO3A1Q9UIG8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLCO3A1Q9UIG8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLCO3A1Q9UIG8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLCO3A1Q9UIG8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLCO3A1Q9UIG8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLCO3A1Q9UIG8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLCO3A1Q9UIG8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLCO3A1Q9UIG8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLCO3A1Q9UIG8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLCO3A1Q9UIG8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLCO3A1Q9UIG8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLCO3A1Q9UIG8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms