Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPN3Q9UHW5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPN3Q9UHW5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPN3Q9UHW5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPN3Q9UHW5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPN3Q9UHW5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPN3Q9UHW5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPN3Q9UHW5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GPN3Q9UHW5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPN3Q9UHW5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPN3Q9UHW5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPN3Q9UHW5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GPN3Q9UHW5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPN3Q9UHW5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GPN3Q9UHW5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPN3Q9UHW5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPN3Q9UHW5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPN3Q9UHW5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPN3Q9UHW5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPN3Q9UHW5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPN3Q9UHW5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GPN3Q9UHW5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPN3Q9UHW5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPN3Q9UHW5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPN3Q9UHW5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GPN3Q9UHW5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPN3Q9UHW5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPN3Q9UHW5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GPN3Q9UHW5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GPN3Q9UHW5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPN3Q9UHW5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPN3Q9UHW5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPN3Q9UHW5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPN3Q9UHW5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPN3Q9UHW5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPN3Q9UHW5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPN3Q9UHW5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPN3Q9UHW5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPN3Q9UHW5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPN3Q9UHW5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPN3Q9UHW5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPN3Q9UHW5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPN3Q9UHW5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPN3Q9UHW5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPN3Q9UHW5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPN3Q9UHW5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPN3Q9UHW5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPN3Q9UHW5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPN3Q9UHW5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPN3Q9UHW5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPN3Q9UHW5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPN3Q9UHW5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPN3Q9UHW5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPN3Q9UHW5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPN3Q9UHW5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPN3Q9UHW5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPN3Q9UHW5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPN3Q9UHW5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GPN3Q9UHW5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPN3Q9UHW5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPN3Q9UHW5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GPN3Q9UHW5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPN3Q9UHW5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPN3Q9UHW5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPN3Q9UHW5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPN3Q9UHW5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GPN3Q9UHW5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GPN3Q9UHW5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPN3Q9UHW5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPN3Q9UHW5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPN3Q9UHW5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPN3Q9UHW5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPN3Q9UHW5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPN3Q9UHW5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPN3Q9UHW5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPN3Q9UHW5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPN3Q9UHW5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPN3Q9UHW5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPN3Q9UHW5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GPN3Q9UHW5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPN3Q9UHW5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GPN3Q9UHW5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPN3Q9UHW5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPN3Q9UHW5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 508.5 ms