Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTNAP2Q9UHC6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTNAP2Q9UHC6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTNAP2Q9UHC6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTNAP2Q9UHC6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTNAP2Q9UHC6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTNAP2Q9UHC6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTNAP2Q9UHC6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTNAP2Q9UHC6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTNAP2Q9UHC6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
CNTNAP2Q9UHC6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CNTNAP2Q9UHC6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CNTNAP2Q9UHC6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CNTNAP2Q9UHC6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CNTNAP2Q9UHC6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CNTNAP2Q9UHC6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
CNTNAP2Q9UHC6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
CNTNAP2Q9UHC6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CNTNAP2Q9UHC6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNTNAP2Q9UHC6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNTNAP2Q9UHC6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNTNAP2Q9UHC6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CNTNAP2Q9UHC6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNTNAP2Q9UHC6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNTNAP2Q9UHC6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CNTNAP2Q9UHC6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNTNAP2Q9UHC6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNTNAP2Q9UHC6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNTNAP2Q9UHC6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CNTNAP2Q9UHC6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNTNAP2Q9UHC6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNTNAP2Q9UHC6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNTNAP2Q9UHC6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNTNAP2Q9UHC6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNTNAP2Q9UHC6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNTNAP2Q9UHC6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CNTNAP2Q9UHC6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CNTNAP2Q9UHC6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CNTNAP2Q9UHC6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNTNAP2Q9UHC6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNTNAP2Q9UHC6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNTNAP2Q9UHC6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNTNAP2Q9UHC6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNTNAP2Q9UHC6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNTNAP2Q9UHC6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTNAP2Q9UHC6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTNAP2Q9UHC6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTNAP2Q9UHC6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTNAP2Q9UHC6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTNAP2Q9UHC6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTNAP2Q9UHC6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTNAP2Q9UHC6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTNAP2Q9UHC6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNTNAP2Q9UHC6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNTNAP2Q9UHC6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CNTNAP2Q9UHC6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CNTNAP2Q9UHC6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CNTNAP2Q9UHC6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
CNTNAP2Q9UHC6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CNTNAP2Q9UHC6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
CNTNAP2Q9UHC6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTNAP2Q9UHC6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTNAP2Q9UHC6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTNAP2Q9UHC6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTNAP2Q9UHC6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTNAP2Q9UHC6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTNAP2Q9UHC6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTNAP2Q9UHC6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTNAP2Q9UHC6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTNAP2Q9UHC6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTNAP2Q9UHC6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTNAP2Q9UHC6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTNAP2Q9UHC6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTNAP2Q9UHC6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTNAP2Q9UHC6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTNAP2Q9UHC6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTNAP2Q9UHC6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTNAP2Q9UHC6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTNAP2Q9UHC6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTNAP2Q9UHC6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTNAP2Q9UHC6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTNAP2Q9UHC6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTNAP2Q9UHC6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNTNAP2Q9UHC6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNTNAP2Q9UHC6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNTNAP2Q9UHC6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNTNAP2Q9UHC6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNTNAP2Q9UHC6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTNAP2Q9UHC6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTNAP2Q9UHC6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTNAP2Q9UHC6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTNAP2Q9UHC6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTNAP2Q9UHC6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTNAP2Q9UHC6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTNAP2Q9UHC6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTNAP2Q9UHC6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTNAP2Q9UHC6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms