Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGI6

KCNN3, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN3Q9UGI6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KCNN3Q9UGI6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNN3Q9UGI6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KCNN3Q9UGI6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms