Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBI1

COMMD3, COMM domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 195 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD3Q9UBI1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COMMD3Q9UBI1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COMMD3Q9UBI1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COMMD3Q9UBI1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COMMD3Q9UBI1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COMMD3Q9UBI1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COMMD3Q9UBI1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
COMMD3Q9UBI1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COMMD3Q9UBI1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
COMMD3Q9UBI1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
COMMD3Q9UBI1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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