Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARHGAP28Q9P2N2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARHGAP28Q9P2N2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARHGAP28Q9P2N2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARHGAP28Q9P2N2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARHGAP28Q9P2N2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARHGAP28Q9P2N2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
ARHGAP28Q9P2N2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARHGAP28Q9P2N2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARHGAP28Q9P2N2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARHGAP28Q9P2N2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARHGAP28Q9P2N2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARHGAP28Q9P2N2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ARHGAP28Q9P2N2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ARHGAP28Q9P2N2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARHGAP28Q9P2N2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARHGAP28Q9P2N2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARHGAP28Q9P2N2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARHGAP28Q9P2N2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARHGAP28Q9P2N2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARHGAP28Q9P2N2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARHGAP28Q9P2N2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARHGAP28Q9P2N2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARHGAP28Q9P2N2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ARHGAP28Q9P2N2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARHGAP28Q9P2N2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARHGAP28Q9P2N2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARHGAP28Q9P2N2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARHGAP28Q9P2N2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARHGAP28Q9P2N2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARHGAP28Q9P2N2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ARHGAP28Q9P2N2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARHGAP28Q9P2N2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARHGAP28Q9P2N2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ARHGAP28Q9P2N2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ARHGAP28Q9P2N2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ARHGAP28Q9P2N2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
ARHGAP28Q9P2N2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGAP28Q9P2N2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGAP28Q9P2N2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGAP28Q9P2N2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGAP28Q9P2N2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGAP28Q9P2N2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGAP28Q9P2N2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ARHGAP28Q9P2N2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGAP28Q9P2N2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGAP28Q9P2N2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGAP28Q9P2N2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ARHGAP28Q9P2N2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGAP28Q9P2N2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGAP28Q9P2N2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGAP28Q9P2N2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ARHGAP28Q9P2N2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGAP28Q9P2N2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGAP28Q9P2N2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGAP28Q9P2N2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGAP28Q9P2N2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ARHGAP28Q9P2N2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms