Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALCOCO1Q9P1Z2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALCOCO1Q9P1Z2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALCOCO1Q9P1Z2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CALCOCO1Q9P1Z2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALCOCO1Q9P1Z2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALCOCO1Q9P1Z2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALCOCO1Q9P1Z2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CALCOCO1Q9P1Z2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CALCOCO1Q9P1Z2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CALCOCO1Q9P1Z2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CALCOCO1Q9P1Z2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CALCOCO1Q9P1Z2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CALCOCO1Q9P1Z2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CALCOCO1Q9P1Z2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CALCOCO1Q9P1Z2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CALCOCO1Q9P1Z2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CALCOCO1Q9P1Z2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CALCOCO1Q9P1Z2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CALCOCO1Q9P1Z2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALCOCO1Q9P1Z2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALCOCO1Q9P1Z2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALCOCO1Q9P1Z2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALCOCO1Q9P1Z2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALCOCO1Q9P1Z2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALCOCO1Q9P1Z2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALCOCO1Q9P1Z2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALCOCO1Q9P1Z2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALCOCO1Q9P1Z2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CALCOCO1Q9P1Z2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALCOCO1Q9P1Z2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALCOCO1Q9P1Z2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALCOCO1Q9P1Z2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALCOCO1Q9P1Z2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CALCOCO1Q9P1Z2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CALCOCO1Q9P1Z2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CALCOCO1Q9P1Z2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CALCOCO1Q9P1Z2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CALCOCO1Q9P1Z2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CALCOCO1Q9P1Z2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CALCOCO1Q9P1Z2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALCOCO1Q9P1Z2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALCOCO1Q9P1Z2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALCOCO1Q9P1Z2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CALCOCO1Q9P1Z2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CALCOCO1Q9P1Z2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CALCOCO1Q9P1Z2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALCOCO1Q9P1Z2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALCOCO1Q9P1Z2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALCOCO1Q9P1Z2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALCOCO1Q9P1Z2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALCOCO1Q9P1Z2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CALCOCO1Q9P1Z2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALCOCO1Q9P1Z2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALCOCO1Q9P1Z2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALCOCO1Q9P1Z2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALCOCO1Q9P1Z2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CALCOCO1Q9P1Z2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALCOCO1Q9P1Z2 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALCOCO1Q9P1Z2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALCOCO1Q9P1Z2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALCOCO1Q9P1Z2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALCOCO1Q9P1Z2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALCOCO1Q9P1Z2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALCOCO1Q9P1Z2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALCOCO1Q9P1Z2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CALCOCO1Q9P1Z2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CALCOCO1Q9P1Z2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms