Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PKD2L1Q9P0L9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PKD2L1Q9P0L9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PKD2L1Q9P0L9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PKD2L1Q9P0L9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PKD2L1Q9P0L9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PKD2L1Q9P0L9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PKD2L1Q9P0L9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PKD2L1Q9P0L9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PKD2L1Q9P0L9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PKD2L1Q9P0L9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PKD2L1Q9P0L9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PKD2L1Q9P0L9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PKD2L1Q9P0L9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PKD2L1Q9P0L9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PKD2L1Q9P0L9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
PKD2L1Q9P0L9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PKD2L1Q9P0L9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PKD2L1Q9P0L9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PKD2L1Q9P0L9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PKD2L1Q9P0L9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PKD2L1Q9P0L9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKD2L1Q9P0L9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKD2L1Q9P0L9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PKD2L1Q9P0L9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKD2L1Q9P0L9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKD2L1Q9P0L9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PKD2L1Q9P0L9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PKD2L1Q9P0L9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKD2L1Q9P0L9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKD2L1Q9P0L9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKD2L1Q9P0L9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKD2L1Q9P0L9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKD2L1Q9P0L9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PKD2L1Q9P0L9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PKD2L1Q9P0L9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKD2L1Q9P0L9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PKD2L1Q9P0L9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PKD2L1Q9P0L9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PKD2L1Q9P0L9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PKD2L1Q9P0L9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKD2L1Q9P0L9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKD2L1Q9P0L9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKD2L1Q9P0L9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKD2L1Q9P0L9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKD2L1Q9P0L9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PKD2L1Q9P0L9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PKD2L1Q9P0L9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKD2L1Q9P0L9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PKD2L1Q9P0L9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PKD2L1Q9P0L9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKD2L1Q9P0L9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PKD2L1Q9P0L9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PKD2L1Q9P0L9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PKD2L1Q9P0L9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PKD2L1Q9P0L9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PKD2L1Q9P0L9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKD2L1Q9P0L9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKD2L1Q9P0L9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKD2L1Q9P0L9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PKD2L1Q9P0L9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PKD2L1Q9P0L9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PKD2L1Q9P0L9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PKD2L1Q9P0L9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PKD2L1Q9P0L9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PKD2L1Q9P0L9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PKD2L1Q9P0L9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PKD2L1Q9P0L9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PKD2L1Q9P0L9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKD2L1Q9P0L9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKD2L1Q9P0L9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PKD2L1Q9P0L9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PKD2L1Q9P0L9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PKD2L1Q9P0L9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PKD2L1Q9P0L9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PKD2L1Q9P0L9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKD2L1Q9P0L9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKD2L1Q9P0L9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKD2L1Q9P0L9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKD2L1Q9P0L9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKD2L1Q9P0L9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PKD2L1Q9P0L9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKD2L1Q9P0L9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKD2L1Q9P0L9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKD2L1Q9P0L9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKD2L1Q9P0L9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PKD2L1Q9P0L9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKD2L1Q9P0L9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKD2L1Q9P0L9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKD2L1Q9P0L9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PKD2L1Q9P0L9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PKD2L1Q9P0L9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PKD2L1Q9P0L9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PKD2L1Q9P0L9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PKD2L1Q9P0L9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PKD2L1Q9P0L9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PKD2L1Q9P0L9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PKD2L1Q9P0L9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PKD2L1Q9P0L9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PKD2L1Q9P0L9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms