Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC59Q9P031 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC59Q9P031 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC59Q9P031 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC59Q9P031 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC59Q9P031 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC59Q9P031 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC59Q9P031 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC59Q9P031 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC59Q9P031 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC59Q9P031 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC59Q9P031 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC59Q9P031 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC59Q9P031 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC59Q9P031 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC59Q9P031 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC59Q9P031 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC59Q9P031 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC59Q9P031 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC59Q9P031 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC59Q9P031 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC59Q9P031 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC59Q9P031 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC59Q9P031 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC59Q9P031 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC59Q9P031 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC59Q9P031 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC59Q9P031 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC59Q9P031 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC59Q9P031 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC59Q9P031 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC59Q9P031 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC59Q9P031 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC59Q9P031 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC59Q9P031 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC59Q9P031 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC59Q9P031 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms