Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TMOD2Q9NZR1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TMOD2Q9NZR1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TMOD2Q9NZR1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMOD2Q9NZR1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMOD2Q9NZR1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMOD2Q9NZR1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMOD2Q9NZR1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TMOD2Q9NZR1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMOD2Q9NZR1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMOD2Q9NZR1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMOD2Q9NZR1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMOD2Q9NZR1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMOD2Q9NZR1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMOD2Q9NZR1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMOD2Q9NZR1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMOD2Q9NZR1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMOD2Q9NZR1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TMOD2Q9NZR1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMOD2Q9NZR1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMOD2Q9NZR1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMOD2Q9NZR1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMOD2Q9NZR1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TMOD2Q9NZR1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMOD2Q9NZR1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TMOD2Q9NZR1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMOD2Q9NZR1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMOD2Q9NZR1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMOD2Q9NZR1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMOD2Q9NZR1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TMOD2Q9NZR1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMOD2Q9NZR1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMOD2Q9NZR1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMOD2Q9NZR1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TMOD2Q9NZR1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TMOD2Q9NZR1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMOD2Q9NZR1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMOD2Q9NZR1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TMOD2Q9NZR1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMOD2Q9NZR1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMOD2Q9NZR1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TMOD2Q9NZR1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TMOD2Q9NZR1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TMOD2Q9NZR1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMOD2Q9NZR1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMOD2Q9NZR1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMOD2Q9NZR1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TMOD2Q9NZR1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMOD2Q9NZR1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMOD2Q9NZR1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TMOD2Q9NZR1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TMOD2Q9NZR1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMOD2Q9NZR1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMOD2Q9NZR1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMOD2Q9NZR1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMOD2Q9NZR1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
TMOD2Q9NZR1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMOD2Q9NZR1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TMOD2Q9NZR1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMOD2Q9NZR1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMOD2Q9NZR1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMOD2Q9NZR1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TMOD2Q9NZR1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMOD2Q9NZR1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMOD2Q9NZR1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMOD2Q9NZR1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TMOD2Q9NZR1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMOD2Q9NZR1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMOD2Q9NZR1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMOD2Q9NZR1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TMOD2Q9NZR1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMOD2Q9NZR1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMOD2Q9NZR1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMOD2Q9NZR1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMOD2Q9NZR1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMOD2Q9NZR1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMOD2Q9NZR1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TMOD2Q9NZR1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMOD2Q9NZR1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMOD2Q9NZR1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TMOD2Q9NZR1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMOD2Q9NZR1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMOD2Q9NZR1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMOD2Q9NZR1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMOD2Q9NZR1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMOD2Q9NZR1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMOD2Q9NZR1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TMOD2Q9NZR1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMOD2Q9NZR1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMOD2Q9NZR1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMOD2Q9NZR1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMOD2Q9NZR1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TMOD2Q9NZR1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMOD2Q9NZR1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMOD2Q9NZR1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMOD2Q9NZR1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMOD2Q9NZR1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TMOD2Q9NZR1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMOD2Q9NZR1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TMOD2Q9NZR1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms