Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYOFQ9NZM1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYOFQ9NZM1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYOFQ9NZM1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MYOFQ9NZM1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYOFQ9NZM1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYOFQ9NZM1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MYOFQ9NZM1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYOFQ9NZM1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYOFQ9NZM1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MYOFQ9NZM1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYOFQ9NZM1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MYOFQ9NZM1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYOFQ9NZM1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYOFQ9NZM1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYOFQ9NZM1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MYOFQ9NZM1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYOFQ9NZM1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYOFQ9NZM1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MYOFQ9NZM1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYOFQ9NZM1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYOFQ9NZM1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYOFQ9NZM1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MYOFQ9NZM1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYOFQ9NZM1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MYOFQ9NZM1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MYOFQ9NZM1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYOFQ9NZM1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYOFQ9NZM1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MYOFQ9NZM1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MYOFQ9NZM1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYOFQ9NZM1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYOFQ9NZM1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYOFQ9NZM1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MYOFQ9NZM1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYOFQ9NZM1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYOFQ9NZM1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYOFQ9NZM1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYOFQ9NZM1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYOFQ9NZM1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYOFQ9NZM1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYOFQ9NZM1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYOFQ9NZM1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYOFQ9NZM1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MYOFQ9NZM1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYOFQ9NZM1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYOFQ9NZM1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYOFQ9NZM1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYOFQ9NZM1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MYOFQ9NZM1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYOFQ9NZM1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYOFQ9NZM1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYOFQ9NZM1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYOFQ9NZM1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYOFQ9NZM1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MYOFQ9NZM1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYOFQ9NZM1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYOFQ9NZM1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYOFQ9NZM1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYOFQ9NZM1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MYOFQ9NZM1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MYOFQ9NZM1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYOFQ9NZM1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYOFQ9NZM1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYOFQ9NZM1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MYOFQ9NZM1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYOFQ9NZM1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYOFQ9NZM1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MYOFQ9NZM1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYOFQ9NZM1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYOFQ9NZM1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYOFQ9NZM1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYOFQ9NZM1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MYOFQ9NZM1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOFQ9NZM1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOFQ9NZM1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOFQ9NZM1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOFQ9NZM1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOFQ9NZM1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOFQ9NZM1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOFQ9NZM1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOFQ9NZM1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOFQ9NZM1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MYOFQ9NZM1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYOFQ9NZM1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MYOFQ9NZM1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
MYOFQ9NZM1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYOFQ9NZM1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYOFQ9NZM1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYOFQ9NZM1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYOFQ9NZM1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MYOFQ9NZM1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYOFQ9NZM1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYOFQ9NZM1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYOFQ9NZM1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MYOFQ9NZM1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYOFQ9NZM1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYOFQ9NZM1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYOFQ9NZM1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MYOFQ9NZM1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms