Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ09

UBAP1, Ubiquitin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP1Q9NZ09 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBAP1Q9NZ09 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBAP1Q9NZ09 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBAP1Q9NZ09 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBAP1Q9NZ09 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UBAP1Q9NZ09 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBAP1Q9NZ09 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBAP1Q9NZ09 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
UBAP1Q9NZ09 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBAP1Q9NZ09 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBAP1Q9NZ09 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBAP1Q9NZ09 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBAP1Q9NZ09 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBAP1Q9NZ09 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBAP1Q9NZ09 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBAP1Q9NZ09 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBAP1Q9NZ09 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBAP1Q9NZ09 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBAP1Q9NZ09 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBAP1Q9NZ09 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBAP1Q9NZ09 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBAP1Q9NZ09 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBAP1Q9NZ09 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBAP1Q9NZ09 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBAP1Q9NZ09 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBAP1Q9NZ09 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBAP1Q9NZ09 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBAP1Q9NZ09 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
UBAP1Q9NZ09 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBAP1Q9NZ09 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBAP1Q9NZ09 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBAP1Q9NZ09 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBAP1Q9NZ09 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBAP1Q9NZ09 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBAP1Q9NZ09 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBAP1Q9NZ09 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBAP1Q9NZ09 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBAP1Q9NZ09 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBAP1Q9NZ09 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBAP1Q9NZ09 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBAP1Q9NZ09 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBAP1Q9NZ09 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBAP1Q9NZ09 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBAP1Q9NZ09 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBAP1Q9NZ09 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBAP1Q9NZ09 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBAP1Q9NZ09 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBAP1Q9NZ09 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBAP1Q9NZ09 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBAP1Q9NZ09 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBAP1Q9NZ09 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UBAP1Q9NZ09 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBAP1Q9NZ09 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBAP1Q9NZ09 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBAP1Q9NZ09 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBAP1Q9NZ09 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UBAP1Q9NZ09 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBAP1Q9NZ09 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBAP1Q9NZ09 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBAP1Q9NZ09 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBAP1Q9NZ09 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBAP1Q9NZ09 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBAP1Q9NZ09 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBAP1Q9NZ09 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBAP1Q9NZ09 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBAP1Q9NZ09 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBAP1Q9NZ09 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBAP1Q9NZ09 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBAP1Q9NZ09 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBAP1Q9NZ09 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBAP1Q9NZ09 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBAP1Q9NZ09 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBAP1Q9NZ09 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBAP1Q9NZ09 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBAP1Q9NZ09 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBAP1Q9NZ09 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBAP1Q9NZ09 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBAP1Q9NZ09 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBAP1Q9NZ09 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBAP1Q9NZ09 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBAP1Q9NZ09 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBAP1Q9NZ09 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBAP1Q9NZ09 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBAP1Q9NZ09 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBAP1Q9NZ09 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBAP1Q9NZ09 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBAP1Q9NZ09 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBAP1Q9NZ09 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBAP1Q9NZ09 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBAP1Q9NZ09 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBAP1Q9NZ09 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBAP1Q9NZ09 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBAP1Q9NZ09 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms