Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL5

CYP39A1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP39A1Q9NYL5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYP39A1Q9NYL5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP39A1Q9NYL5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP39A1Q9NYL5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP39A1Q9NYL5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP39A1Q9NYL5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP39A1Q9NYL5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYP39A1Q9NYL5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYP39A1Q9NYL5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP39A1Q9NYL5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP39A1Q9NYL5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CYP39A1Q9NYL5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP39A1Q9NYL5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP39A1Q9NYL5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP39A1Q9NYL5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP39A1Q9NYL5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CYP39A1Q9NYL5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CYP39A1Q9NYL5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CYP39A1Q9NYL5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CYP39A1Q9NYL5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CYP39A1Q9NYL5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CYP39A1Q9NYL5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CYP39A1Q9NYL5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP39A1Q9NYL5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CYP39A1Q9NYL5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP39A1Q9NYL5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP39A1Q9NYL5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP39A1Q9NYL5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP39A1Q9NYL5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CYP39A1Q9NYL5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP39A1Q9NYL5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP39A1Q9NYL5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CYP39A1Q9NYL5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP39A1Q9NYL5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP39A1Q9NYL5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP39A1Q9NYL5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP39A1Q9NYL5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CYP39A1Q9NYL5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYP39A1Q9NYL5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYP39A1Q9NYL5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYP39A1Q9NYL5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYP39A1Q9NYL5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CYP39A1Q9NYL5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYP39A1Q9NYL5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYP39A1Q9NYL5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYP39A1Q9NYL5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYP39A1Q9NYL5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYP39A1Q9NYL5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYP39A1Q9NYL5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYP39A1Q9NYL5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYP39A1Q9NYL5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYP39A1Q9NYL5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYP39A1Q9NYL5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYP39A1Q9NYL5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYP39A1Q9NYL5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYP39A1Q9NYL5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP39A1Q9NYL5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP39A1Q9NYL5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP39A1Q9NYL5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYP39A1Q9NYL5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYP39A1Q9NYL5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYP39A1Q9NYL5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP39A1Q9NYL5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP39A1Q9NYL5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP39A1Q9NYL5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP39A1Q9NYL5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP39A1Q9NYL5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP39A1Q9NYL5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP39A1Q9NYL5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP39A1Q9NYL5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP39A1Q9NYL5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP39A1Q9NYL5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP39A1Q9NYL5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP39A1Q9NYL5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CYP39A1Q9NYL5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CYP39A1Q9NYL5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CYP39A1Q9NYL5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CYP39A1Q9NYL5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CYP39A1Q9NYL5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYP39A1Q9NYL5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CYP39A1Q9NYL5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP39A1Q9NYL5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP39A1Q9NYL5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP39A1Q9NYL5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP39A1Q9NYL5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYP39A1Q9NYL5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYP39A1Q9NYL5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP39A1Q9NYL5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP39A1Q9NYL5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP39A1Q9NYL5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP39A1Q9NYL5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP39A1Q9NYL5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP39A1Q9NYL5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP39A1Q9NYL5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP39A1Q9NYL5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP39A1Q9NYL5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CYP39A1Q9NYL5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CYP39A1Q9NYL5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CYP39A1Q9NYL5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CYP39A1Q9NYL5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms