Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL2

ARHGEF38, Rho guanine nucleotide exchange factor 38, humanhuman

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF38Q9NXL2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ARHGEF38Q9NXL2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARHGEF38Q9NXL2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARHGEF38Q9NXL2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARHGEF38Q9NXL2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARHGEF38Q9NXL2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARHGEF38Q9NXL2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARHGEF38Q9NXL2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ARHGEF38Q9NXL2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ARHGEF38Q9NXL2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARHGEF38Q9NXL2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARHGEF38Q9NXL2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGEF38Q9NXL2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGEF38Q9NXL2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGEF38Q9NXL2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGEF38Q9NXL2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGEF38Q9NXL2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGEF38Q9NXL2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGEF38Q9NXL2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGEF38Q9NXL2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARHGEF38Q9NXL2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGEF38Q9NXL2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGEF38Q9NXL2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGEF38Q9NXL2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARHGEF38Q9NXL2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF38Q9NXL2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF38Q9NXL2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF38Q9NXL2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF38Q9NXL2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF38Q9NXL2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARHGEF38Q9NXL2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF38Q9NXL2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF38Q9NXL2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF38Q9NXL2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF38Q9NXL2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF38Q9NXL2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF38Q9NXL2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ARHGEF38Q9NXL2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGEF38Q9NXL2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGEF38Q9NXL2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGEF38Q9NXL2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGEF38Q9NXL2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ARHGEF38Q9NXL2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARHGEF38Q9NXL2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARHGEF38Q9NXL2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARHGEF38Q9NXL2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARHGEF38Q9NXL2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGEF38Q9NXL2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGEF38Q9NXL2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGEF38Q9NXL2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGEF38Q9NXL2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGEF38Q9NXL2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ARHGEF38Q9NXL2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGEF38Q9NXL2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGEF38Q9NXL2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGEF38Q9NXL2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGEF38Q9NXL2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGEF38Q9NXL2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGEF38Q9NXL2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGEF38Q9NXL2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGEF38Q9NXL2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ARHGEF38Q9NXL2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGEF38Q9NXL2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARHGEF38Q9NXL2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGEF38Q9NXL2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARHGEF38Q9NXL2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF38Q9NXL2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF38Q9NXL2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF38Q9NXL2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF38Q9NXL2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF38Q9NXL2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF38Q9NXL2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF38Q9NXL2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARHGEF38Q9NXL2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGEF38Q9NXL2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGEF38Q9NXL2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGEF38Q9NXL2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGEF38Q9NXL2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGEF38Q9NXL2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ARHGEF38Q9NXL2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGEF38Q9NXL2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGEF38Q9NXL2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGEF38Q9NXL2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ARHGEF38Q9NXL2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF38Q9NXL2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF38Q9NXL2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF38Q9NXL2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARHGEF38Q9NXL2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF38Q9NXL2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF38Q9NXL2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF38Q9NXL2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF38Q9NXL2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF38Q9NXL2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF38Q9NXL2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF38Q9NXL2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ARHGEF38Q9NXL2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF38Q9NXL2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF38Q9NXL2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ARHGEF38Q9NXL2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms