Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CWC25Q9NXE8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CWC25Q9NXE8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CWC25Q9NXE8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CWC25Q9NXE8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CWC25Q9NXE8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CWC25Q9NXE8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CWC25Q9NXE8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC31■■■□□ 2.55
CWC25Q9NXE8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
CWC25Q9NXE8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CWC25Q9NXE8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CWC25Q9NXE8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CWC25Q9NXE8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CWC25Q9NXE8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CWC25Q9NXE8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CWC25Q9NXE8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
CWC25Q9NXE8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CWC25Q9NXE8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CWC25Q9NXE8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CWC25Q9NXE8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CWC25Q9NXE8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
CWC25Q9NXE8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CWC25Q9NXE8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CWC25Q9NXE8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CWC25Q9NXE8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CWC25Q9NXE8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CWC25Q9NXE8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
CWC25Q9NXE8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
CWC25Q9NXE8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CWC25Q9NXE8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CWC25Q9NXE8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CWC25Q9NXE8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CWC25Q9NXE8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CWC25Q9NXE8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CWC25Q9NXE8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CWC25Q9NXE8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CWC25Q9NXE8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CWC25Q9NXE8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CWC25Q9NXE8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CWC25Q9NXE8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CWC25Q9NXE8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CWC25Q9NXE8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CWC25Q9NXE8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CWC25Q9NXE8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CWC25Q9NXE8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CWC25Q9NXE8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CWC25Q9NXE8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CWC25Q9NXE8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CWC25Q9NXE8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CWC25Q9NXE8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CWC25Q9NXE8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CWC25Q9NXE8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CWC25Q9NXE8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CWC25Q9NXE8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CWC25Q9NXE8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CWC25Q9NXE8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CWC25Q9NXE8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CWC25Q9NXE8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
CWC25Q9NXE8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CWC25Q9NXE8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CWC25Q9NXE8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CWC25Q9NXE8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CWC25Q9NXE8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CWC25Q9NXE8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CWC25Q9NXE8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CWC25Q9NXE8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CWC25Q9NXE8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CWC25Q9NXE8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CWC25Q9NXE8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CWC25Q9NXE8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CWC25Q9NXE8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CWC25Q9NXE8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CWC25Q9NXE8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CWC25Q9NXE8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CWC25Q9NXE8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CWC25Q9NXE8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CWC25Q9NXE8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CWC25Q9NXE8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CWC25Q9NXE8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CWC25Q9NXE8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
CWC25Q9NXE8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CWC25Q9NXE8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CWC25Q9NXE8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
CWC25Q9NXE8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
CWC25Q9NXE8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
CWC25Q9NXE8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
CWC25Q9NXE8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CWC25Q9NXE8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CWC25Q9NXE8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CWC25Q9NXE8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
CWC25Q9NXE8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
CWC25Q9NXE8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CWC25Q9NXE8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CWC25Q9NXE8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CWC25Q9NXE8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CWC25Q9NXE8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CWC25Q9NXE8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CWC25Q9NXE8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CWC25Q9NXE8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CWC25Q9NXE8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.8 ms