Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMTM6Q9NX76 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMTM6Q9NX76 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CMTM6Q9NX76 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CMTM6Q9NX76 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CMTM6Q9NX76 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CMTM6Q9NX76 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CMTM6Q9NX76 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CMTM6Q9NX76 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CMTM6Q9NX76 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CMTM6Q9NX76 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CMTM6Q9NX76 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CMTM6Q9NX76 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CMTM6Q9NX76 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CMTM6Q9NX76 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CMTM6Q9NX76 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CMTM6Q9NX76 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CMTM6Q9NX76 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMTM6Q9NX76 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMTM6Q9NX76 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CMTM6Q9NX76 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMTM6Q9NX76 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMTM6Q9NX76 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMTM6Q9NX76 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMTM6Q9NX76 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CMTM6Q9NX76 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMTM6Q9NX76 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMTM6Q9NX76 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMTM6Q9NX76 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMTM6Q9NX76 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMTM6Q9NX76 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMTM6Q9NX76 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMTM6Q9NX76 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMTM6Q9NX76 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CMTM6Q9NX76 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CMTM6Q9NX76 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CMTM6Q9NX76 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CMTM6Q9NX76 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CMTM6Q9NX76 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CMTM6Q9NX76 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CMTM6Q9NX76 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMTM6Q9NX76 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMTM6Q9NX76 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMTM6Q9NX76 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMTM6Q9NX76 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMTM6Q9NX76 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CMTM6Q9NX76 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMTM6Q9NX76 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CMTM6Q9NX76 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CMTM6Q9NX76 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMTM6Q9NX76 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMTM6Q9NX76 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMTM6Q9NX76 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMTM6Q9NX76 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMTM6Q9NX76 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CMTM6Q9NX76 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMTM6Q9NX76 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CMTM6Q9NX76 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMTM6Q9NX76 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMTM6Q9NX76 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMTM6Q9NX76 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CMTM6Q9NX76 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMTM6Q9NX76 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMTM6Q9NX76 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CMTM6Q9NX76 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CMTM6Q9NX76 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CMTM6Q9NX76 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CMTM6Q9NX76 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CMTM6Q9NX76 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CMTM6Q9NX76 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMTM6Q9NX76 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMTM6Q9NX76 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMTM6Q9NX76 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMTM6Q9NX76 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CMTM6Q9NX76 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMTM6Q9NX76 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMTM6Q9NX76 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMTM6Q9NX76 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMTM6Q9NX76 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMTM6Q9NX76 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CMTM6Q9NX76 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CMTM6Q9NX76 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CMTM6Q9NX76 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CMTM6Q9NX76 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CMTM6Q9NX76 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CMTM6Q9NX76 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CMTM6Q9NX76 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CMTM6Q9NX76 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CMTM6Q9NX76 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CMTM6Q9NX76 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMTM6Q9NX76 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMTM6Q9NX76 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CMTM6Q9NX76 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMTM6Q9NX76 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMTM6Q9NX76 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CMTM6Q9NX76 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMTM6Q9NX76 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMTM6Q9NX76 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMTM6Q9NX76 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CMTM6Q9NX76 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms