Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD3

SETD4, SET domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4Q9NVD3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SETD4Q9NVD3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SETD4Q9NVD3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SETD4Q9NVD3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SETD4Q9NVD3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SETD4Q9NVD3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SETD4Q9NVD3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SETD4Q9NVD3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SETD4Q9NVD3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SETD4Q9NVD3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SETD4Q9NVD3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SETD4Q9NVD3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SETD4Q9NVD3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD4Q9NVD3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD4Q9NVD3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD4Q9NVD3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD4Q9NVD3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD4Q9NVD3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD4Q9NVD3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD4Q9NVD3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SETD4Q9NVD3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SETD4Q9NVD3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SETD4Q9NVD3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SETD4Q9NVD3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SETD4Q9NVD3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETD4Q9NVD3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETD4Q9NVD3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SETD4Q9NVD3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETD4Q9NVD3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETD4Q9NVD3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETD4Q9NVD3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETD4Q9NVD3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD4Q9NVD3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD4Q9NVD3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD4Q9NVD3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD4Q9NVD3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD4Q9NVD3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETD4Q9NVD3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETD4Q9NVD3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETD4Q9NVD3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETD4Q9NVD3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETD4Q9NVD3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD4Q9NVD3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD4Q9NVD3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD4Q9NVD3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD4Q9NVD3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD4Q9NVD3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD4Q9NVD3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETD4Q9NVD3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SETD4Q9NVD3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETD4Q9NVD3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SETD4Q9NVD3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETD4Q9NVD3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETD4Q9NVD3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETD4Q9NVD3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SETD4Q9NVD3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD4Q9NVD3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD4Q9NVD3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD4Q9NVD3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD4Q9NVD3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD4Q9NVD3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD4Q9NVD3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD4Q9NVD3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SETD4Q9NVD3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SETD4Q9NVD3 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SETD4Q9NVD3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SETD4Q9NVD3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD4Q9NVD3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD4Q9NVD3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD4Q9NVD3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD4Q9NVD3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD4Q9NVD3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD4Q9NVD3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SETD4Q9NVD3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SETD4Q9NVD3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SETD4Q9NVD3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SETD4Q9NVD3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SETD4Q9NVD3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SETD4Q9NVD3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SETD4Q9NVD3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SETD4Q9NVD3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SETD4Q9NVD3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SETD4Q9NVD3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SETD4Q9NVD3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SETD4Q9NVD3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SETD4Q9NVD3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SETD4Q9NVD3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SETD4Q9NVD3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SETD4Q9NVD3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SETD4Q9NVD3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SETD4Q9NVD3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SETD4Q9NVD3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SETD4Q9NVD3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SETD4Q9NVD3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SETD4Q9NVD3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SETD4Q9NVD3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SETD4Q9NVD3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SETD4Q9NVD3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETD4Q9NVD3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETD4Q9NVD3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms