Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX7

RNF146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF146Q9NTX7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF146Q9NTX7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF146Q9NTX7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RNF146Q9NTX7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF146Q9NTX7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF146Q9NTX7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNF146Q9NTX7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RNF146Q9NTX7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RNF146Q9NTX7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RNF146Q9NTX7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF146Q9NTX7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF146Q9NTX7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RNF146Q9NTX7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF146Q9NTX7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF146Q9NTX7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF146Q9NTX7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RNF146Q9NTX7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNF146Q9NTX7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF146Q9NTX7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF146Q9NTX7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNF146Q9NTX7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF146Q9NTX7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF146Q9NTX7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF146Q9NTX7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF146Q9NTX7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF146Q9NTX7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNF146Q9NTX7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF146Q9NTX7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF146Q9NTX7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF146Q9NTX7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF146Q9NTX7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNF146Q9NTX7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNF146Q9NTX7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF146Q9NTX7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RNF146Q9NTX7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF146Q9NTX7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF146Q9NTX7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF146Q9NTX7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF146Q9NTX7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNF146Q9NTX7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF146Q9NTX7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF146Q9NTX7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF146Q9NTX7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF146Q9NTX7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF146Q9NTX7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RNF146Q9NTX7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF146Q9NTX7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF146Q9NTX7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RNF146Q9NTX7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF146Q9NTX7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF146Q9NTX7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF146Q9NTX7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF146Q9NTX7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF146Q9NTX7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF146Q9NTX7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNF146Q9NTX7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF146Q9NTX7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNF146Q9NTX7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF146Q9NTX7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF146Q9NTX7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF146Q9NTX7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNF146Q9NTX7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF146Q9NTX7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF146Q9NTX7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF146Q9NTX7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF146Q9NTX7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF146Q9NTX7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF146Q9NTX7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF146Q9NTX7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF146Q9NTX7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNF146Q9NTX7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF146Q9NTX7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF146Q9NTX7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNF146Q9NTX7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF146Q9NTX7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF146Q9NTX7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF146Q9NTX7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNF146Q9NTX7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF146Q9NTX7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF146Q9NTX7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF146Q9NTX7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF146Q9NTX7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNF146Q9NTX7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF146Q9NTX7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF146Q9NTX7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF146Q9NTX7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF146Q9NTX7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNF146Q9NTX7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF146Q9NTX7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNF146Q9NTX7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF146Q9NTX7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF146Q9NTX7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF146Q9NTX7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF146Q9NTX7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF146Q9NTX7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF146Q9NTX7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF146Q9NTX7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNF146Q9NTX7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF146Q9NTX7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNF146Q9NTX7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms