Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GJB4Q9NTQ9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJB4Q9NTQ9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJB4Q9NTQ9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJB4Q9NTQ9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJB4Q9NTQ9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJB4Q9NTQ9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJB4Q9NTQ9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GJB4Q9NTQ9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GJB4Q9NTQ9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GJB4Q9NTQ9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GJB4Q9NTQ9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GJB4Q9NTQ9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
GJB4Q9NTQ9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJB4Q9NTQ9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJB4Q9NTQ9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJB4Q9NTQ9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJB4Q9NTQ9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJB4Q9NTQ9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJB4Q9NTQ9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJB4Q9NTQ9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJB4Q9NTQ9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJB4Q9NTQ9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJB4Q9NTQ9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJB4Q9NTQ9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJB4Q9NTQ9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJB4Q9NTQ9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJB4Q9NTQ9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GJB4Q9NTQ9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GJB4Q9NTQ9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GJB4Q9NTQ9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GJB4Q9NTQ9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GJB4Q9NTQ9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GJB4Q9NTQ9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GJB4Q9NTQ9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GJB4Q9NTQ9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GJB4Q9NTQ9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJB4Q9NTQ9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJB4Q9NTQ9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GJB4Q9NTQ9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJB4Q9NTQ9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJB4Q9NTQ9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJB4Q9NTQ9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJB4Q9NTQ9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJB4Q9NTQ9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GJB4Q9NTQ9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJB4Q9NTQ9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GJB4Q9NTQ9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GJB4Q9NTQ9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GJB4Q9NTQ9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GJB4Q9NTQ9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GJB4Q9NTQ9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GJB4Q9NTQ9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GJB4Q9NTQ9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GJB4Q9NTQ9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GJB4Q9NTQ9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GJB4Q9NTQ9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GJB4Q9NTQ9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GJB4Q9NTQ9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
GJB4Q9NTQ9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GJB4Q9NTQ9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GJB4Q9NTQ9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
GJB4Q9NTQ9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJB4Q9NTQ9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJB4Q9NTQ9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJB4Q9NTQ9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJB4Q9NTQ9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GJB4Q9NTQ9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
GJB4Q9NTQ9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GJB4Q9NTQ9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GJB4Q9NTQ9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJB4Q9NTQ9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GJB4Q9NTQ9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJB4Q9NTQ9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJB4Q9NTQ9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJB4Q9NTQ9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJB4Q9NTQ9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJB4Q9NTQ9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJB4Q9NTQ9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJB4Q9NTQ9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GJB4Q9NTQ9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJB4Q9NTQ9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GJB4Q9NTQ9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJB4Q9NTQ9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJB4Q9NTQ9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJB4Q9NTQ9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJB4Q9NTQ9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJB4Q9NTQ9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
GJB4Q9NTQ9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
GJB4Q9NTQ9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GJB4Q9NTQ9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
GJB4Q9NTQ9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GJB4Q9NTQ9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GJB4Q9NTQ9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
GJB4Q9NTQ9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
GJB4Q9NTQ9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GJB4Q9NTQ9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GJB4Q9NTQ9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
GJB4Q9NTQ9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
GJB4Q9NTQ9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms