Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATP8A2Q9NTI2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP8A2Q9NTI2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP8A2Q9NTI2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP8A2Q9NTI2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP8A2Q9NTI2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP8A2Q9NTI2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATP8A2Q9NTI2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP8A2Q9NTI2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP8A2Q9NTI2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATP8A2Q9NTI2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP8A2Q9NTI2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP8A2Q9NTI2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP8A2Q9NTI2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP8A2Q9NTI2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATP8A2Q9NTI2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATP8A2Q9NTI2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATP8A2Q9NTI2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATP8A2Q9NTI2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATP8A2Q9NTI2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ATP8A2Q9NTI2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATP8A2Q9NTI2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATP8A2Q9NTI2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP8A2Q9NTI2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
ATP8A2Q9NTI2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP8A2Q9NTI2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP8A2Q9NTI2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP8A2Q9NTI2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATP8A2Q9NTI2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
ATP8A2Q9NTI2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP8A2Q9NTI2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP8A2Q9NTI2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP8A2Q9NTI2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATP8A2Q9NTI2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP8A2Q9NTI2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATP8A2Q9NTI2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP8A2Q9NTI2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP8A2Q9NTI2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP8A2Q9NTI2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATP8A2Q9NTI2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP8A2Q9NTI2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP8A2Q9NTI2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP8A2Q9NTI2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP8A2Q9NTI2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP8A2Q9NTI2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP8A2Q9NTI2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATP8A2Q9NTI2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP8A2Q9NTI2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP8A2Q9NTI2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP8A2Q9NTI2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP8A2Q9NTI2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP8A2Q9NTI2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATP8A2Q9NTI2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP8A2Q9NTI2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATP8A2Q9NTI2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP8A2Q9NTI2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP8A2Q9NTI2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP8A2Q9NTI2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP8A2Q9NTI2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATP8A2Q9NTI2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP8A2Q9NTI2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ATP8A2Q9NTI2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP8A2Q9NTI2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP8A2Q9NTI2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP8A2Q9NTI2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP8A2Q9NTI2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP8A2Q9NTI2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP8A2Q9NTI2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP8A2Q9NTI2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATP8A2Q9NTI2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP8A2Q9NTI2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP8A2Q9NTI2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATP8A2Q9NTI2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP8A2Q9NTI2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP8A2Q9NTI2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ATP8A2Q9NTI2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP8A2Q9NTI2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP8A2Q9NTI2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP8A2Q9NTI2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ATP8A2Q9NTI2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP8A2Q9NTI2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP8A2Q9NTI2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP8A2Q9NTI2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP8A2Q9NTI2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
ATP8A2Q9NTI2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
ATP8A2Q9NTI2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP8A2Q9NTI2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP8A2Q9NTI2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ATP8A2Q9NTI2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP8A2Q9NTI2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP8A2Q9NTI2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP8A2Q9NTI2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP8A2Q9NTI2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP8A2Q9NTI2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP8A2Q9NTI2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
ATP8A2Q9NTI2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP8A2Q9NTI2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP8A2Q9NTI2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP8A2Q9NTI2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ATP8A2Q9NTI2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms