Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKDREJQ9NTG1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKDREJQ9NTG1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKDREJQ9NTG1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKDREJQ9NTG1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PKDREJQ9NTG1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKDREJQ9NTG1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKDREJQ9NTG1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKDREJQ9NTG1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKDREJQ9NTG1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKDREJQ9NTG1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKDREJQ9NTG1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKDREJQ9NTG1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKDREJQ9NTG1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKDREJQ9NTG1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKDREJQ9NTG1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PKDREJQ9NTG1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKDREJQ9NTG1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PKDREJQ9NTG1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKDREJQ9NTG1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKDREJQ9NTG1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKDREJQ9NTG1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKDREJQ9NTG1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PKDREJQ9NTG1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKDREJQ9NTG1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKDREJQ9NTG1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKDREJQ9NTG1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKDREJQ9NTG1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKDREJQ9NTG1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKDREJQ9NTG1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PKDREJQ9NTG1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKDREJQ9NTG1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKDREJQ9NTG1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKDREJQ9NTG1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PKDREJQ9NTG1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKDREJQ9NTG1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKDREJQ9NTG1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKDREJQ9NTG1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKDREJQ9NTG1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PKDREJQ9NTG1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PKDREJQ9NTG1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PKDREJQ9NTG1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PKDREJQ9NTG1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKDREJQ9NTG1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKDREJQ9NTG1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKDREJQ9NTG1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PKDREJQ9NTG1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PKDREJQ9NTG1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKDREJQ9NTG1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PKDREJQ9NTG1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PKDREJQ9NTG1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKDREJQ9NTG1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKDREJQ9NTG1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PKDREJQ9NTG1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKDREJQ9NTG1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKDREJQ9NTG1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKDREJQ9NTG1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PKDREJQ9NTG1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKDREJQ9NTG1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKDREJQ9NTG1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKDREJQ9NTG1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKDREJQ9NTG1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PKDREJQ9NTG1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKDREJQ9NTG1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKDREJQ9NTG1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKDREJQ9NTG1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PKDREJQ9NTG1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKDREJQ9NTG1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKDREJQ9NTG1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKDREJQ9NTG1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PKDREJQ9NTG1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PKDREJQ9NTG1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms