Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS56

TOPORS, E3 ubiquitin-protein ligase Topors, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPORSQ9NS56 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOPORSQ9NS56 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TOPORSQ9NS56 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TOPORSQ9NS56 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TOPORSQ9NS56 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOPORSQ9NS56 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOPORSQ9NS56 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOPORSQ9NS56 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOPORSQ9NS56 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TOPORSQ9NS56 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TOPORSQ9NS56 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TOPORSQ9NS56 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TOPORSQ9NS56 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TOPORSQ9NS56 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TOPORSQ9NS56 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TOPORSQ9NS56 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TOPORSQ9NS56 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TOPORSQ9NS56 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TOPORSQ9NS56 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TOPORSQ9NS56 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TOPORSQ9NS56 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TOPORSQ9NS56 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TOPORSQ9NS56 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TOPORSQ9NS56 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TOPORSQ9NS56 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOPORSQ9NS56 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOPORSQ9NS56 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOPORSQ9NS56 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TOPORSQ9NS56 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOPORSQ9NS56 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOPORSQ9NS56 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TOPORSQ9NS56 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOPORSQ9NS56 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOPORSQ9NS56 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOPORSQ9NS56 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOPORSQ9NS56 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TOPORSQ9NS56 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOPORSQ9NS56 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOPORSQ9NS56 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOPORSQ9NS56 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TOPORSQ9NS56 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOPORSQ9NS56 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOPORSQ9NS56 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TOPORSQ9NS56 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TOPORSQ9NS56 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOPORSQ9NS56 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOPORSQ9NS56 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOPORSQ9NS56 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOPORSQ9NS56 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOPORSQ9NS56 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOPORSQ9NS56 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TOPORSQ9NS56 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOPORSQ9NS56 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOPORSQ9NS56 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOPORSQ9NS56 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOPORSQ9NS56 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TOPORSQ9NS56 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOPORSQ9NS56 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOPORSQ9NS56 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOPORSQ9NS56 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOPORSQ9NS56 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOPORSQ9NS56 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TOPORSQ9NS56 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOPORSQ9NS56 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TOPORSQ9NS56 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOPORSQ9NS56 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
TOPORSQ9NS56 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOPORSQ9NS56 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TOPORSQ9NS56 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOPORSQ9NS56 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOPORSQ9NS56 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOPORSQ9NS56 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TOPORSQ9NS56 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TOPORSQ9NS56 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TOPORSQ9NS56 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOPORSQ9NS56 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOPORSQ9NS56 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOPORSQ9NS56 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TOPORSQ9NS56 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TOPORSQ9NS56 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TOPORSQ9NS56 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOPORSQ9NS56 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOPORSQ9NS56 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TOPORSQ9NS56 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOPORSQ9NS56 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOPORSQ9NS56 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOPORSQ9NS56 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOPORSQ9NS56 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TOPORSQ9NS56 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TOPORSQ9NS56 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOPORSQ9NS56 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOPORSQ9NS56 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOPORSQ9NS56 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TOPORSQ9NS56 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOPORSQ9NS56 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOPORSQ9NS56 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOPORSQ9NS56 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOPORSQ9NS56 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOPORSQ9NS56 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TOPORSQ9NS56 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms