Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERINC1Q9NRX5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERINC1Q9NRX5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERINC1Q9NRX5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERINC1Q9NRX5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERINC1Q9NRX5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERINC1Q9NRX5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SERINC1Q9NRX5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERINC1Q9NRX5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERINC1Q9NRX5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERINC1Q9NRX5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SERINC1Q9NRX5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERINC1Q9NRX5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SERINC1Q9NRX5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERINC1Q9NRX5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERINC1Q9NRX5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERINC1Q9NRX5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SERINC1Q9NRX5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SERINC1Q9NRX5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SERINC1Q9NRX5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERINC1Q9NRX5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERINC1Q9NRX5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERINC1Q9NRX5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERINC1Q9NRX5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERINC1Q9NRX5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SERINC1Q9NRX5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
SERINC1Q9NRX5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SERINC1Q9NRX5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SERINC1Q9NRX5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms