Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR96

TLR9, Toll-like receptor 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR9Q9NR96 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TLR9Q9NR96 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TLR9Q9NR96 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TLR9Q9NR96 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TLR9Q9NR96 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TLR9Q9NR96 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TLR9Q9NR96 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TLR9Q9NR96 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TLR9Q9NR96 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TLR9Q9NR96 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TLR9Q9NR96 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TLR9Q9NR96 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TLR9Q9NR96 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TLR9Q9NR96 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TLR9Q9NR96 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TLR9Q9NR96 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TLR9Q9NR96 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TLR9Q9NR96 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TLR9Q9NR96 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TLR9Q9NR96 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TLR9Q9NR96 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TLR9Q9NR96 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TLR9Q9NR96 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TLR9Q9NR96 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TLR9Q9NR96 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TLR9Q9NR96 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TLR9Q9NR96 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TLR9Q9NR96 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TLR9Q9NR96 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TLR9Q9NR96 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TLR9Q9NR96 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TLR9Q9NR96 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TLR9Q9NR96 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TLR9Q9NR96 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TLR9Q9NR96 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TLR9Q9NR96 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TLR9Q9NR96 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TLR9Q9NR96 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TLR9Q9NR96 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TLR9Q9NR96 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TLR9Q9NR96 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TLR9Q9NR96 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TLR9Q9NR96 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TLR9Q9NR96 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TLR9Q9NR96 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TLR9Q9NR96 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TLR9Q9NR96 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TLR9Q9NR96 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TLR9Q9NR96 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TLR9Q9NR96 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TLR9Q9NR96 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TLR9Q9NR96 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TLR9Q9NR96 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TLR9Q9NR96 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TLR9Q9NR96 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TLR9Q9NR96 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TLR9Q9NR96 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TLR9Q9NR96 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TLR9Q9NR96 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TLR9Q9NR96 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TLR9Q9NR96 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TLR9Q9NR96 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TLR9Q9NR96 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TLR9Q9NR96 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TLR9Q9NR96 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TLR9Q9NR96 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TLR9Q9NR96 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TLR9Q9NR96 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TLR9Q9NR96 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TLR9Q9NR96 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TLR9Q9NR96 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TLR9Q9NR96 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TLR9Q9NR96 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TLR9Q9NR96 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TLR9Q9NR96 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TLR9Q9NR96 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TLR9Q9NR96 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TLR9Q9NR96 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TLR9Q9NR96 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TLR9Q9NR96 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TLR9Q9NR96 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TLR9Q9NR96 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TLR9Q9NR96 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TLR9Q9NR96 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TLR9Q9NR96 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TLR9Q9NR96 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TLR9Q9NR96 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TLR9Q9NR96 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TLR9Q9NR96 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TLR9Q9NR96 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TLR9Q9NR96 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TLR9Q9NR96 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TLR9Q9NR96 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TLR9Q9NR96 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TLR9Q9NR96 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TLR9Q9NR96 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TLR9Q9NR96 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TLR9Q9NR96 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TLR9Q9NR96 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TLR9Q9NR96 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms