Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ50

MRPL40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL40Q9NQ50 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL40Q9NQ50 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL40Q9NQ50 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL40Q9NQ50 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL40Q9NQ50 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL40Q9NQ50 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL40Q9NQ50 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MRPL40Q9NQ50 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MRPL40Q9NQ50 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MRPL40Q9NQ50 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MRPL40Q9NQ50 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MRPL40Q9NQ50 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MRPL40Q9NQ50 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MRPL40Q9NQ50 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL40Q9NQ50 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL40Q9NQ50 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL40Q9NQ50 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPL40Q9NQ50 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL40Q9NQ50 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL40Q9NQ50 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL40Q9NQ50 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL40Q9NQ50 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL40Q9NQ50 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL40Q9NQ50 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL40Q9NQ50 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL40Q9NQ50 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL40Q9NQ50 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRPL40Q9NQ50 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL40Q9NQ50 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL40Q9NQ50 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL40Q9NQ50 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL40Q9NQ50 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRPL40Q9NQ50 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPL40Q9NQ50 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPL40Q9NQ50 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRPL40Q9NQ50 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MRPL40Q9NQ50 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL40Q9NQ50 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL40Q9NQ50 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL40Q9NQ50 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL40Q9NQ50 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL40Q9NQ50 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL40Q9NQ50 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL40Q9NQ50 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL40Q9NQ50 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL40Q9NQ50 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL40Q9NQ50 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL40Q9NQ50 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL40Q9NQ50 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL40Q9NQ50 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL40Q9NQ50 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MRPL40Q9NQ50 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL40Q9NQ50 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL40Q9NQ50 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL40Q9NQ50 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL40Q9NQ50 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL40Q9NQ50 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL40Q9NQ50 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPL40Q9NQ50 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPL40Q9NQ50 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPL40Q9NQ50 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPL40Q9NQ50 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPL40Q9NQ50 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPL40Q9NQ50 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL40Q9NQ50 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL40Q9NQ50 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL40Q9NQ50 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL40Q9NQ50 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL40Q9NQ50 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL40Q9NQ50 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL40Q9NQ50 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL40Q9NQ50 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL40Q9NQ50 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL40Q9NQ50 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPL40Q9NQ50 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPL40Q9NQ50 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPL40Q9NQ50 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPL40Q9NQ50 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL40Q9NQ50 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL40Q9NQ50 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL40Q9NQ50 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRPL40Q9NQ50 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL40Q9NQ50 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL40Q9NQ50 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL40Q9NQ50 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL40Q9NQ50 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL40Q9NQ50 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRPL40Q9NQ50 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MRPL40Q9NQ50 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL40Q9NQ50 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms