Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ36

SCUBE2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCUBE2Q9NQ36 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCUBE2Q9NQ36 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCUBE2Q9NQ36 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCUBE2Q9NQ36 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCUBE2Q9NQ36 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCUBE2Q9NQ36 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCUBE2Q9NQ36 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCUBE2Q9NQ36 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCUBE2Q9NQ36 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCUBE2Q9NQ36 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCUBE2Q9NQ36 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCUBE2Q9NQ36 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SCUBE2Q9NQ36 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SCUBE2Q9NQ36 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCUBE2Q9NQ36 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCUBE2Q9NQ36 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCUBE2Q9NQ36 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCUBE2Q9NQ36 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCUBE2Q9NQ36 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCUBE2Q9NQ36 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCUBE2Q9NQ36 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SCUBE2Q9NQ36 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SCUBE2Q9NQ36 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCUBE2Q9NQ36 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCUBE2Q9NQ36 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SCUBE2Q9NQ36 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCUBE2Q9NQ36 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCUBE2Q9NQ36 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCUBE2Q9NQ36 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCUBE2Q9NQ36 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SCUBE2Q9NQ36 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCUBE2Q9NQ36 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCUBE2Q9NQ36 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCUBE2Q9NQ36 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SCUBE2Q9NQ36 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCUBE2Q9NQ36 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCUBE2Q9NQ36 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCUBE2Q9NQ36 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCUBE2Q9NQ36 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCUBE2Q9NQ36 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCUBE2Q9NQ36 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCUBE2Q9NQ36 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCUBE2Q9NQ36 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCUBE2Q9NQ36 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCUBE2Q9NQ36 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCUBE2Q9NQ36 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCUBE2Q9NQ36 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCUBE2Q9NQ36 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCUBE2Q9NQ36 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCUBE2Q9NQ36 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCUBE2Q9NQ36 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCUBE2Q9NQ36 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCUBE2Q9NQ36 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCUBE2Q9NQ36 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCUBE2Q9NQ36 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCUBE2Q9NQ36 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCUBE2Q9NQ36 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCUBE2Q9NQ36 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SCUBE2Q9NQ36 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCUBE2Q9NQ36 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCUBE2Q9NQ36 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCUBE2Q9NQ36 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCUBE2Q9NQ36 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCUBE2Q9NQ36 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCUBE2Q9NQ36 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCUBE2Q9NQ36 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCUBE2Q9NQ36 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCUBE2Q9NQ36 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCUBE2Q9NQ36 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCUBE2Q9NQ36 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCUBE2Q9NQ36 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCUBE2Q9NQ36 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCUBE2Q9NQ36 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCUBE2Q9NQ36 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCUBE2Q9NQ36 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SCUBE2Q9NQ36 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCUBE2Q9NQ36 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCUBE2Q9NQ36 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCUBE2Q9NQ36 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCUBE2Q9NQ36 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SCUBE2Q9NQ36 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCUBE2Q9NQ36 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCUBE2Q9NQ36 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCUBE2Q9NQ36 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCUBE2Q9NQ36 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCUBE2Q9NQ36 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCUBE2Q9NQ36 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCUBE2Q9NQ36 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCUBE2Q9NQ36 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCUBE2Q9NQ36 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCUBE2Q9NQ36 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCUBE2Q9NQ36 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCUBE2Q9NQ36 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCUBE2Q9NQ36 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCUBE2Q9NQ36 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCUBE2Q9NQ36 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCUBE2Q9NQ36 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCUBE2Q9NQ36 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCUBE2Q9NQ36 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCUBE2Q9NQ36 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms