Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ11

ATP13A2, Cation-transporting ATPase 13A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A2Q9NQ11 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP13A2Q9NQ11 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP13A2Q9NQ11 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP13A2Q9NQ11 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP13A2Q9NQ11 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP13A2Q9NQ11 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP13A2Q9NQ11 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP13A2Q9NQ11 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP13A2Q9NQ11 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP13A2Q9NQ11 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP13A2Q9NQ11 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP13A2Q9NQ11 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP13A2Q9NQ11 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP13A2Q9NQ11 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP13A2Q9NQ11 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP13A2Q9NQ11 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP13A2Q9NQ11 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP13A2Q9NQ11 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP13A2Q9NQ11 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP13A2Q9NQ11 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP13A2Q9NQ11 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP13A2Q9NQ11 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP13A2Q9NQ11 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP13A2Q9NQ11 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP13A2Q9NQ11 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP13A2Q9NQ11 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP13A2Q9NQ11 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP13A2Q9NQ11 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP13A2Q9NQ11 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP13A2Q9NQ11 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms