Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC96

CAPN10, Calpain-10, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN10Q9HC96 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN10Q9HC96 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN10Q9HC96 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN10Q9HC96 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN10Q9HC96 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN10Q9HC96 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CAPN10Q9HC96 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN10Q9HC96 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN10Q9HC96 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN10Q9HC96 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN10Q9HC96 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CAPN10Q9HC96 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAPN10Q9HC96 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CAPN10Q9HC96 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN10Q9HC96 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN10Q9HC96 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN10Q9HC96 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN10Q9HC96 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN10Q9HC96 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN10Q9HC96 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN10Q9HC96 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN10Q9HC96 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN10Q9HC96 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN10Q9HC96 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CAPN10Q9HC96 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN10Q9HC96 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN10Q9HC96 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CAPN10Q9HC96 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN10Q9HC96 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN10Q9HC96 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN10Q9HC96 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN10Q9HC96 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN10Q9HC96 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CAPN10Q9HC96 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN10Q9HC96 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN10Q9HC96 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN10Q9HC96 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN10Q9HC96 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN10Q9HC96 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CAPN10Q9HC96 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN10Q9HC96 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN10Q9HC96 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN10Q9HC96 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN10Q9HC96 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN10Q9HC96 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN10Q9HC96 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CAPN10Q9HC96 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN10Q9HC96 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN10Q9HC96 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN10Q9HC96 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN10Q9HC96 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CAPN10Q9HC96 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CAPN10Q9HC96 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CAPN10Q9HC96 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CAPN10Q9HC96 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CAPN10Q9HC96 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN10Q9HC96 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN10Q9HC96 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CAPN10Q9HC96 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms