Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBA0

TRPV4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPV4Q9HBA0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TRPV4Q9HBA0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRPV4Q9HBA0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TRPV4Q9HBA0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRPV4Q9HBA0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TRPV4Q9HBA0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRPV4Q9HBA0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRPV4Q9HBA0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TRPV4Q9HBA0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRPV4Q9HBA0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRPV4Q9HBA0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TRPV4Q9HBA0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRPV4Q9HBA0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRPV4Q9HBA0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRPV4Q9HBA0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRPV4Q9HBA0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRPV4Q9HBA0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRPV4Q9HBA0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRPV4Q9HBA0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TRPV4Q9HBA0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TRPV4Q9HBA0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRPV4Q9HBA0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRPV4Q9HBA0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRPV4Q9HBA0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRPV4Q9HBA0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRPV4Q9HBA0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRPV4Q9HBA0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRPV4Q9HBA0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRPV4Q9HBA0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TRPV4Q9HBA0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRPV4Q9HBA0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRPV4Q9HBA0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRPV4Q9HBA0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TRPV4Q9HBA0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPV4Q9HBA0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPV4Q9HBA0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPV4Q9HBA0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPV4Q9HBA0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPV4Q9HBA0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TRPV4Q9HBA0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
TRPV4Q9HBA0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TRPV4Q9HBA0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPV4Q9HBA0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPV4Q9HBA0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPV4Q9HBA0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPV4Q9HBA0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPV4Q9HBA0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPV4Q9HBA0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPV4Q9HBA0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TRPV4Q9HBA0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPV4Q9HBA0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPV4Q9HBA0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPV4Q9HBA0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TRPV4Q9HBA0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPV4Q9HBA0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPV4Q9HBA0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPV4Q9HBA0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPV4Q9HBA0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPV4Q9HBA0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPV4Q9HBA0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TRPV4Q9HBA0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPV4Q9HBA0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPV4Q9HBA0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TRPV4Q9HBA0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TRPV4Q9HBA0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRPV4Q9HBA0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRPV4Q9HBA0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRPV4Q9HBA0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRPV4Q9HBA0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPV4Q9HBA0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPV4Q9HBA0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPV4Q9HBA0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPV4Q9HBA0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPV4Q9HBA0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPV4Q9HBA0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRPV4Q9HBA0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRPV4Q9HBA0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRPV4Q9HBA0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRPV4Q9HBA0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRPV4Q9HBA0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRPV4Q9HBA0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPV4Q9HBA0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPV4Q9HBA0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPV4Q9HBA0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRPV4Q9HBA0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPV4Q9HBA0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPV4Q9HBA0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPV4Q9HBA0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRPV4Q9HBA0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRPV4Q9HBA0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRPV4Q9HBA0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRPV4Q9HBA0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRPV4Q9HBA0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPV4Q9HBA0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPV4Q9HBA0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRPV4Q9HBA0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPV4Q9HBA0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPV4Q9HBA0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPV4Q9HBA0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TRPV4Q9HBA0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms