Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9K5

ERVMER34-1, Endogenous retrovirus group MER34 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVMER34-1Q9H9K5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ERVMER34-1Q9H9K5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVMER34-1Q9H9K5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVMER34-1Q9H9K5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVMER34-1Q9H9K5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERVMER34-1Q9H9K5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVMER34-1Q9H9K5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVMER34-1Q9H9K5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVMER34-1Q9H9K5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERVMER34-1Q9H9K5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVMER34-1Q9H9K5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVMER34-1Q9H9K5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVMER34-1Q9H9K5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVMER34-1Q9H9K5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVMER34-1Q9H9K5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERVMER34-1Q9H9K5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVMER34-1Q9H9K5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVMER34-1Q9H9K5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVMER34-1Q9H9K5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVMER34-1Q9H9K5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERVMER34-1Q9H9K5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVMER34-1Q9H9K5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVMER34-1Q9H9K5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVMER34-1Q9H9K5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ERVMER34-1Q9H9K5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVMER34-1Q9H9K5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVMER34-1Q9H9K5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERVMER34-1Q9H9K5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERVMER34-1Q9H9K5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms