Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8M5

CNNM2, Metal transporter CNNM2, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM2Q9H8M5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CNNM2Q9H8M5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNNM2Q9H8M5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNNM2Q9H8M5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNNM2Q9H8M5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNNM2Q9H8M5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CNNM2Q9H8M5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
CNNM2Q9H8M5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNNM2Q9H8M5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNNM2Q9H8M5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNNM2Q9H8M5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CNNM2Q9H8M5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNNM2Q9H8M5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNNM2Q9H8M5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CNNM2Q9H8M5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNNM2Q9H8M5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNNM2Q9H8M5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CNNM2Q9H8M5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNNM2Q9H8M5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CNNM2Q9H8M5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNNM2Q9H8M5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CNNM2Q9H8M5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNNM2Q9H8M5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNNM2Q9H8M5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNNM2Q9H8M5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CNNM2Q9H8M5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNNM2Q9H8M5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNNM2Q9H8M5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNNM2Q9H8M5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CNNM2Q9H8M5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNNM2Q9H8M5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CNNM2Q9H8M5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNNM2Q9H8M5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNNM2Q9H8M5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNNM2Q9H8M5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNNM2Q9H8M5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CNNM2Q9H8M5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNNM2Q9H8M5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNNM2Q9H8M5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNNM2Q9H8M5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNNM2Q9H8M5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNNM2Q9H8M5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CNNM2Q9H8M5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CNNM2Q9H8M5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CNNM2Q9H8M5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CNNM2Q9H8M5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CNNM2Q9H8M5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNNM2Q9H8M5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNNM2Q9H8M5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CNNM2Q9H8M5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CNNM2Q9H8M5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNNM2Q9H8M5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNNM2Q9H8M5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNNM2Q9H8M5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNNM2Q9H8M5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CNNM2Q9H8M5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNNM2Q9H8M5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CNNM2Q9H8M5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNNM2Q9H8M5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNNM2Q9H8M5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNNM2Q9H8M5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNNM2Q9H8M5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNNM2Q9H8M5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNNM2Q9H8M5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNNM2Q9H8M5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNNM2Q9H8M5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CNNM2Q9H8M5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNNM2Q9H8M5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNNM2Q9H8M5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNNM2Q9H8M5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNNM2Q9H8M5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNNM2Q9H8M5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNNM2Q9H8M5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CNNM2Q9H8M5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNNM2Q9H8M5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNNM2Q9H8M5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNNM2Q9H8M5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNNM2Q9H8M5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CNNM2Q9H8M5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNNM2Q9H8M5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNNM2Q9H8M5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CNNM2Q9H8M5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CNNM2Q9H8M5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CNNM2Q9H8M5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CNNM2Q9H8M5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNNM2Q9H8M5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CNNM2Q9H8M5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNNM2Q9H8M5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNNM2Q9H8M5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNNM2Q9H8M5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNNM2Q9H8M5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNNM2Q9H8M5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNNM2Q9H8M5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNNM2Q9H8M5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CNNM2Q9H8M5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CNNM2Q9H8M5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNNM2Q9H8M5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CNNM2Q9H8M5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNNM2Q9H8M5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CNNM2Q9H8M5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms