Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7U1

CCSER2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER2Q9H7U1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCSER2Q9H7U1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCSER2Q9H7U1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCSER2Q9H7U1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCSER2Q9H7U1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCSER2Q9H7U1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCSER2Q9H7U1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCSER2Q9H7U1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCSER2Q9H7U1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCSER2Q9H7U1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCSER2Q9H7U1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCSER2Q9H7U1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCSER2Q9H7U1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCSER2Q9H7U1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCSER2Q9H7U1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCSER2Q9H7U1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCSER2Q9H7U1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCSER2Q9H7U1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCSER2Q9H7U1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCSER2Q9H7U1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCSER2Q9H7U1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCSER2Q9H7U1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCSER2Q9H7U1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCSER2Q9H7U1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCSER2Q9H7U1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCSER2Q9H7U1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCSER2Q9H7U1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCSER2Q9H7U1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCSER2Q9H7U1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCSER2Q9H7U1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCSER2Q9H7U1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCSER2Q9H7U1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CCSER2Q9H7U1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCSER2Q9H7U1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCSER2Q9H7U1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCSER2Q9H7U1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCSER2Q9H7U1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCSER2Q9H7U1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCSER2Q9H7U1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCSER2Q9H7U1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCSER2Q9H7U1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCSER2Q9H7U1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCSER2Q9H7U1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCSER2Q9H7U1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCSER2Q9H7U1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCSER2Q9H7U1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCSER2Q9H7U1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCSER2Q9H7U1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCSER2Q9H7U1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CCSER2Q9H7U1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCSER2Q9H7U1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCSER2Q9H7U1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCSER2Q9H7U1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCSER2Q9H7U1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CCSER2Q9H7U1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCSER2Q9H7U1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CCSER2Q9H7U1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCSER2Q9H7U1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCSER2Q9H7U1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCSER2Q9H7U1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CCSER2Q9H7U1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCSER2Q9H7U1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCSER2Q9H7U1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCSER2Q9H7U1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCSER2Q9H7U1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCSER2Q9H7U1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCSER2Q9H7U1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCSER2Q9H7U1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CCSER2Q9H7U1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCSER2Q9H7U1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCSER2Q9H7U1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCSER2Q9H7U1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCSER2Q9H7U1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCSER2Q9H7U1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCSER2Q9H7U1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCSER2Q9H7U1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCSER2Q9H7U1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCSER2Q9H7U1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCSER2Q9H7U1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCSER2Q9H7U1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCSER2Q9H7U1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCSER2Q9H7U1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCSER2Q9H7U1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
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