Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6K4

OPA3, Optic atrophy 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPA3Q9H6K4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
OPA3Q9H6K4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OPA3Q9H6K4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OPA3Q9H6K4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OPA3Q9H6K4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OPA3Q9H6K4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OPA3Q9H6K4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OPA3Q9H6K4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OPA3Q9H6K4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OPA3Q9H6K4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OPA3Q9H6K4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OPA3Q9H6K4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OPA3Q9H6K4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OPA3Q9H6K4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OPA3Q9H6K4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OPA3Q9H6K4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPA3Q9H6K4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPA3Q9H6K4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPA3Q9H6K4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OPA3Q9H6K4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OPA3Q9H6K4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OPA3Q9H6K4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OPA3Q9H6K4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OPA3Q9H6K4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OPA3Q9H6K4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OPA3Q9H6K4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OPA3Q9H6K4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OPA3Q9H6K4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OPA3Q9H6K4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPA3Q9H6K4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPA3Q9H6K4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OPA3Q9H6K4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OPA3Q9H6K4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OPA3Q9H6K4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OPA3Q9H6K4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
OPA3Q9H6K4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OPA3Q9H6K4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
OPA3Q9H6K4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OPA3Q9H6K4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
OPA3Q9H6K4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
OPA3Q9H6K4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
OPA3Q9H6K4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
OPA3Q9H6K4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
OPA3Q9H6K4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OPA3Q9H6K4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OPA3Q9H6K4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OPA3Q9H6K4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
OPA3Q9H6K4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
OPA3Q9H6K4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
OPA3Q9H6K4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
OPA3Q9H6K4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OPA3Q9H6K4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
OPA3Q9H6K4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
OPA3Q9H6K4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
OPA3Q9H6K4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
OPA3Q9H6K4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
OPA3Q9H6K4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
OPA3Q9H6K4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OPA3Q9H6K4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
OPA3Q9H6K4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
OPA3Q9H6K4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
OPA3Q9H6K4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
OPA3Q9H6K4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
OPA3Q9H6K4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
OPA3Q9H6K4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
OPA3Q9H6K4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OPA3Q9H6K4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
OPA3Q9H6K4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms