Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SENP3Q9H4L4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SENP3Q9H4L4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SENP3Q9H4L4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SENP3Q9H4L4 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
SENP3Q9H4L4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SENP3Q9H4L4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SENP3Q9H4L4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SENP3Q9H4L4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
SENP3Q9H4L4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SENP3Q9H4L4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SENP3Q9H4L4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SENP3Q9H4L4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
SENP3Q9H4L4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
SENP3Q9H4L4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SENP3Q9H4L4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SENP3Q9H4L4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SENP3Q9H4L4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SENP3Q9H4L4 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
SENP3Q9H4L4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SENP3Q9H4L4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
SENP3Q9H4L4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SENP3Q9H4L4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SENP3Q9H4L4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SENP3Q9H4L4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SENP3Q9H4L4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
SENP3Q9H4L4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SENP3Q9H4L4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SENP3Q9H4L4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SENP3Q9H4L4 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
SENP3Q9H4L4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SENP3Q9H4L4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SENP3Q9H4L4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SENP3Q9H4L4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SENP3Q9H4L4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SENP3Q9H4L4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SENP3Q9H4L4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SENP3Q9H4L4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SENP3Q9H4L4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC35.64■■■■□ 3.3
SENP3Q9H4L4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SENP3Q9H4L4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SENP3Q9H4L4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SENP3Q9H4L4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
SENP3Q9H4L4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
SENP3Q9H4L4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
SENP3Q9H4L4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
SENP3Q9H4L4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
SENP3Q9H4L4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SENP3Q9H4L4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SENP3Q9H4L4 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
SENP3Q9H4L4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SENP3Q9H4L4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
SENP3Q9H4L4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SENP3Q9H4L4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SENP3Q9H4L4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SENP3Q9H4L4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SENP3Q9H4L4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SENP3Q9H4L4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
SENP3Q9H4L4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
SENP3Q9H4L4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
SENP3Q9H4L4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
SENP3Q9H4L4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SENP3Q9H4L4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SENP3Q9H4L4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SENP3Q9H4L4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SENP3Q9H4L4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
SENP3Q9H4L4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
SENP3Q9H4L4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
SENP3Q9H4L4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
SENP3Q9H4L4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
SENP3Q9H4L4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
SENP3Q9H4L4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
SENP3Q9H4L4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SENP3Q9H4L4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
SENP3Q9H4L4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
SENP3Q9H4L4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SENP3Q9H4L4 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SENP3Q9H4L4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SENP3Q9H4L4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
SENP3Q9H4L4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SENP3Q9H4L4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SENP3Q9H4L4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SENP3Q9H4L4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SENP3Q9H4L4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SENP3Q9H4L4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
SENP3Q9H4L4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
SENP3Q9H4L4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
SENP3Q9H4L4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
SENP3Q9H4L4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
SENP3Q9H4L4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
SENP3Q9H4L4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC35.51■■■■□ 3.27
SENP3Q9H4L4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
SENP3Q9H4L4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SENP3Q9H4L4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
SENP3Q9H4L4 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SENP3Q9H4L4 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SENP3Q9H4L4 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SENP3Q9H4L4 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SENP3Q9H4L4 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SENP3Q9H4L4 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms