Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PDCL3Q9H2J4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDCL3Q9H2J4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDCL3Q9H2J4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDCL3Q9H2J4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDCL3Q9H2J4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDCL3Q9H2J4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDCL3Q9H2J4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDCL3Q9H2J4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDCL3Q9H2J4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDCL3Q9H2J4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDCL3Q9H2J4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDCL3Q9H2J4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDCL3Q9H2J4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDCL3Q9H2J4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDCL3Q9H2J4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDCL3Q9H2J4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PDCL3Q9H2J4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDCL3Q9H2J4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDCL3Q9H2J4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDCL3Q9H2J4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDCL3Q9H2J4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDCL3Q9H2J4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDCL3Q9H2J4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDCL3Q9H2J4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDCL3Q9H2J4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDCL3Q9H2J4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDCL3Q9H2J4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDCL3Q9H2J4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDCL3Q9H2J4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDCL3Q9H2J4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDCL3Q9H2J4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDCL3Q9H2J4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDCL3Q9H2J4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDCL3Q9H2J4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDCL3Q9H2J4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDCL3Q9H2J4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDCL3Q9H2J4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDCL3Q9H2J4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDCL3Q9H2J4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDCL3Q9H2J4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDCL3Q9H2J4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDCL3Q9H2J4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDCL3Q9H2J4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDCL3Q9H2J4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDCL3Q9H2J4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDCL3Q9H2J4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDCL3Q9H2J4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDCL3Q9H2J4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDCL3Q9H2J4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PDCL3Q9H2J4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDCL3Q9H2J4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDCL3Q9H2J4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDCL3Q9H2J4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDCL3Q9H2J4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDCL3Q9H2J4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDCL3Q9H2J4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDCL3Q9H2J4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDCL3Q9H2J4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms