Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCOLN1Q9GZU1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
MCOLN1Q9GZU1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCOLN1Q9GZU1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCOLN1Q9GZU1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCOLN1Q9GZU1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCOLN1Q9GZU1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCOLN1Q9GZU1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCOLN1Q9GZU1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCOLN1Q9GZU1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCOLN1Q9GZU1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCOLN1Q9GZU1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCOLN1Q9GZU1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCOLN1Q9GZU1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCOLN1Q9GZU1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MCOLN1Q9GZU1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCOLN1Q9GZU1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCOLN1Q9GZU1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCOLN1Q9GZU1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCOLN1Q9GZU1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
MCOLN1Q9GZU1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
MCOLN1Q9GZU1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCOLN1Q9GZU1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCOLN1Q9GZU1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MCOLN1Q9GZU1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCOLN1Q9GZU1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCOLN1Q9GZU1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCOLN1Q9GZU1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCOLN1Q9GZU1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCOLN1Q9GZU1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MCOLN1Q9GZU1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCOLN1Q9GZU1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCOLN1Q9GZU1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCOLN1Q9GZU1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCOLN1Q9GZU1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCOLN1Q9GZU1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCOLN1Q9GZU1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MCOLN1Q9GZU1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCOLN1Q9GZU1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCOLN1Q9GZU1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCOLN1Q9GZU1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCOLN1Q9GZU1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCOLN1Q9GZU1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCOLN1Q9GZU1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCOLN1Q9GZU1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCOLN1Q9GZU1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCOLN1Q9GZU1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCOLN1Q9GZU1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCOLN1Q9GZU1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCOLN1Q9GZU1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCOLN1Q9GZU1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCOLN1Q9GZU1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCOLN1Q9GZU1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCOLN1Q9GZU1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCOLN1Q9GZU1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCOLN1Q9GZU1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCOLN1Q9GZU1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCOLN1Q9GZU1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCOLN1Q9GZU1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCOLN1Q9GZU1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCOLN1Q9GZU1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCOLN1Q9GZU1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCOLN1Q9GZU1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCOLN1Q9GZU1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MCOLN1Q9GZU1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCOLN1Q9GZU1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCOLN1Q9GZU1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCOLN1Q9GZU1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCOLN1Q9GZU1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCOLN1Q9GZU1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MCOLN1Q9GZU1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCOLN1Q9GZU1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCOLN1Q9GZU1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCOLN1Q9GZU1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCOLN1Q9GZU1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MCOLN1Q9GZU1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCOLN1Q9GZU1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCOLN1Q9GZU1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCOLN1Q9GZU1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCOLN1Q9GZU1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCOLN1Q9GZU1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCOLN1Q9GZU1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MCOLN1Q9GZU1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCOLN1Q9GZU1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCOLN1Q9GZU1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCOLN1Q9GZU1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCOLN1Q9GZU1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCOLN1Q9GZU1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCOLN1Q9GZU1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCOLN1Q9GZU1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCOLN1Q9GZU1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCOLN1Q9GZU1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCOLN1Q9GZU1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCOLN1Q9GZU1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCOLN1Q9GZU1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCOLN1Q9GZU1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCOLN1Q9GZU1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MCOLN1Q9GZU1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCOLN1Q9GZU1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MCOLN1Q9GZU1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms