Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTR3CQ9C0K3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTR3CQ9C0K3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTR3CQ9C0K3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ACTR3CQ9C0K3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ACTR3CQ9C0K3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
ACTR3CQ9C0K3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms