Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBE2OQ9C0C9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBE2OQ9C0C9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBE2OQ9C0C9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBE2OQ9C0C9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
UBE2OQ9C0C9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE2OQ9C0C9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE2OQ9C0C9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
UBE2OQ9C0C9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
UBE2OQ9C0C9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE2OQ9C0C9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE2OQ9C0C9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE2OQ9C0C9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
UBE2OQ9C0C9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE2OQ9C0C9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE2OQ9C0C9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UBE2OQ9C0C9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBE2OQ9C0C9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBE2OQ9C0C9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBE2OQ9C0C9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBE2OQ9C0C9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBE2OQ9C0C9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UBE2OQ9C0C9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UBE2OQ9C0C9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE2OQ9C0C9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE2OQ9C0C9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UBE2OQ9C0C9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBE2OQ9C0C9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
UBE2OQ9C0C9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBE2OQ9C0C9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBE2OQ9C0C9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UBE2OQ9C0C9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE2OQ9C0C9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UBE2OQ9C0C9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBE2OQ9C0C9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBE2OQ9C0C9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UBE2OQ9C0C9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE2OQ9C0C9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UBE2OQ9C0C9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE2OQ9C0C9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE2OQ9C0C9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE2OQ9C0C9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UBE2OQ9C0C9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE2OQ9C0C9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE2OQ9C0C9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE2OQ9C0C9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE2OQ9C0C9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE2OQ9C0C9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE2OQ9C0C9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE2OQ9C0C9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UBE2OQ9C0C9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE2OQ9C0C9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE2OQ9C0C9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE2OQ9C0C9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UBE2OQ9C0C9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
UBE2OQ9C0C9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
UBE2OQ9C0C9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBE2OQ9C0C9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBE2OQ9C0C9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBE2OQ9C0C9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
UBE2OQ9C0C9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE2OQ9C0C9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE2OQ9C0C9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE2OQ9C0C9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE2OQ9C0C9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE2OQ9C0C9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE2OQ9C0C9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE2OQ9C0C9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
UBE2OQ9C0C9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE2OQ9C0C9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE2OQ9C0C9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE2OQ9C0C9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE2OQ9C0C9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
UBE2OQ9C0C9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBE2OQ9C0C9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
UBE2OQ9C0C9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBE2OQ9C0C9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBE2OQ9C0C9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
UBE2OQ9C0C9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE2OQ9C0C9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE2OQ9C0C9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE2OQ9C0C9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE2OQ9C0C9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE2OQ9C0C9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE2OQ9C0C9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE2OQ9C0C9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
UBE2OQ9C0C9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
UBE2OQ9C0C9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBE2OQ9C0C9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBE2OQ9C0C9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBE2OQ9C0C9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBE2OQ9C0C9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBE2OQ9C0C9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBE2OQ9C0C9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
UBE2OQ9C0C9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE2OQ9C0C9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE2OQ9C0C9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE2OQ9C0C9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
UBE2OQ9C0C9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
UBE2OQ9C0C9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms