Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CIPCQ9C0C6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CIPCQ9C0C6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CIPCQ9C0C6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CIPCQ9C0C6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CIPCQ9C0C6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CIPCQ9C0C6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CIPCQ9C0C6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CIPCQ9C0C6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CIPCQ9C0C6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CIPCQ9C0C6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CIPCQ9C0C6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CIPCQ9C0C6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CIPCQ9C0C6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CIPCQ9C0C6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CIPCQ9C0C6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CIPCQ9C0C6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CIPCQ9C0C6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CIPCQ9C0C6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CIPCQ9C0C6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CIPCQ9C0C6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CIPCQ9C0C6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CIPCQ9C0C6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CIPCQ9C0C6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CIPCQ9C0C6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CIPCQ9C0C6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CIPCQ9C0C6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CIPCQ9C0C6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CIPCQ9C0C6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CIPCQ9C0C6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CIPCQ9C0C6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CIPCQ9C0C6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CIPCQ9C0C6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CIPCQ9C0C6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CIPCQ9C0C6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CIPCQ9C0C6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CIPCQ9C0C6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CIPCQ9C0C6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CIPCQ9C0C6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CIPCQ9C0C6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CIPCQ9C0C6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CIPCQ9C0C6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CIPCQ9C0C6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CIPCQ9C0C6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CIPCQ9C0C6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CIPCQ9C0C6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CIPCQ9C0C6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CIPCQ9C0C6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CIPCQ9C0C6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CIPCQ9C0C6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CIPCQ9C0C6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CIPCQ9C0C6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CIPCQ9C0C6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CIPCQ9C0C6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CIPCQ9C0C6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CIPCQ9C0C6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CIPCQ9C0C6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CIPCQ9C0C6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CIPCQ9C0C6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CIPCQ9C0C6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CIPCQ9C0C6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CIPCQ9C0C6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CIPCQ9C0C6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CIPCQ9C0C6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CIPCQ9C0C6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CIPCQ9C0C6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CIPCQ9C0C6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CIPCQ9C0C6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CIPCQ9C0C6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CIPCQ9C0C6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CIPCQ9C0C6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CIPCQ9C0C6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CIPCQ9C0C6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CIPCQ9C0C6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CIPCQ9C0C6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CIPCQ9C0C6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CIPCQ9C0C6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CIPCQ9C0C6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CIPCQ9C0C6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CIPCQ9C0C6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CIPCQ9C0C6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CIPCQ9C0C6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CIPCQ9C0C6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CIPCQ9C0C6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CIPCQ9C0C6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CIPCQ9C0C6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CIPCQ9C0C6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CIPCQ9C0C6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CIPCQ9C0C6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CIPCQ9C0C6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CIPCQ9C0C6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CIPCQ9C0C6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CIPCQ9C0C6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CIPCQ9C0C6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CIPCQ9C0C6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CIPCQ9C0C6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CIPCQ9C0C6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CIPCQ9C0C6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CIPCQ9C0C6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CIPCQ9C0C6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms