Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDAC8Q9BY41 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC8Q9BY41 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC8Q9BY41 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC8Q9BY41 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDAC8Q9BY41 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC8Q9BY41 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDAC8Q9BY41 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC8Q9BY41 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDAC8Q9BY41 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC8Q9BY41 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC8Q9BY41 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC8Q9BY41 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC8Q9BY41 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC8Q9BY41 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDAC8Q9BY41 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC8Q9BY41 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC8Q9BY41 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC8Q9BY41 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDAC8Q9BY41 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC8Q9BY41 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC8Q9BY41 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC8Q9BY41 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDAC8Q9BY41 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HDAC8Q9BY41 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC8Q9BY41 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC8Q9BY41 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC8Q9BY41 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC8Q9BY41 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC8Q9BY41 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC8Q9BY41 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC8Q9BY41 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDAC8Q9BY41 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC8Q9BY41 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC8Q9BY41 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC8Q9BY41 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC8Q9BY41 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC8Q9BY41 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDAC8Q9BY41 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC8Q9BY41 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC8Q9BY41 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC8Q9BY41 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC8Q9BY41 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC8Q9BY41 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC8Q9BY41 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC8Q9BY41 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC8Q9BY41 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC8Q9BY41 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC8Q9BY41 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC8Q9BY41 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HDAC8Q9BY41 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC8Q9BY41 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HDAC8Q9BY41 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC8Q9BY41 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC8Q9BY41 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC8Q9BY41 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC8Q9BY41 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC8Q9BY41 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC8Q9BY41 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC8Q9BY41 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HDAC8Q9BY41 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HDAC8Q9BY41 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC8Q9BY41 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC8Q9BY41 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC8Q9BY41 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HDAC8Q9BY41 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC8Q9BY41 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC8Q9BY41 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC8Q9BY41 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC8Q9BY41 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC8Q9BY41 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HDAC8Q9BY41 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC8Q9BY41 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC8Q9BY41 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HDAC8Q9BY41 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms