Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PACSIN1Q9BY11 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PACSIN1Q9BY11 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PACSIN1Q9BY11 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PACSIN1Q9BY11 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PACSIN1Q9BY11 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PACSIN1Q9BY11 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PACSIN1Q9BY11 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PACSIN1Q9BY11 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PACSIN1Q9BY11 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PACSIN1Q9BY11 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PACSIN1Q9BY11 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PACSIN1Q9BY11 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PACSIN1Q9BY11 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PACSIN1Q9BY11 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PACSIN1Q9BY11 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PACSIN1Q9BY11 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PACSIN1Q9BY11 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PACSIN1Q9BY11 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PACSIN1Q9BY11 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PACSIN1Q9BY11 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PACSIN1Q9BY11 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PACSIN1Q9BY11 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PACSIN1Q9BY11 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PACSIN1Q9BY11 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PACSIN1Q9BY11 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PACSIN1Q9BY11 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PACSIN1Q9BY11 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PACSIN1Q9BY11 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PACSIN1Q9BY11 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PACSIN1Q9BY11 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PACSIN1Q9BY11 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PACSIN1Q9BY11 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PACSIN1Q9BY11 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PACSIN1Q9BY11 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms