Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLR3CQ9BUI4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
POLR3CQ9BUI4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLR3CQ9BUI4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLR3CQ9BUI4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
POLR3CQ9BUI4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR3CQ9BUI4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR3CQ9BUI4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
POLR3CQ9BUI4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR3CQ9BUI4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLR3CQ9BUI4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR3CQ9BUI4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR3CQ9BUI4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR3CQ9BUI4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR3CQ9BUI4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR3CQ9BUI4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
POLR3CQ9BUI4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR3CQ9BUI4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR3CQ9BUI4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR3CQ9BUI4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR3CQ9BUI4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR3CQ9BUI4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR3CQ9BUI4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR3CQ9BUI4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
POLR3CQ9BUI4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR3CQ9BUI4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR3CQ9BUI4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLR3CQ9BUI4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3CQ9BUI4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3CQ9BUI4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3CQ9BUI4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3CQ9BUI4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3CQ9BUI4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3CQ9BUI4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3CQ9BUI4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3CQ9BUI4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLR3CQ9BUI4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR3CQ9BUI4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR3CQ9BUI4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR3CQ9BUI4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR3CQ9BUI4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR3CQ9BUI4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR3CQ9BUI4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR3CQ9BUI4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR3CQ9BUI4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR3CQ9BUI4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR3CQ9BUI4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR3CQ9BUI4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR3CQ9BUI4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR3CQ9BUI4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR3CQ9BUI4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR3CQ9BUI4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR3CQ9BUI4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR3CQ9BUI4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR3CQ9BUI4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR3CQ9BUI4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR3CQ9BUI4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR3CQ9BUI4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR3CQ9BUI4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms