Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF7

CRB3, Protein crumbs homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB3Q9BUF7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CRB3Q9BUF7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRB3Q9BUF7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRB3Q9BUF7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRB3Q9BUF7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRB3Q9BUF7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRB3Q9BUF7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CRB3Q9BUF7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRB3Q9BUF7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CRB3Q9BUF7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CRB3Q9BUF7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CRB3Q9BUF7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB3Q9BUF7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB3Q9BUF7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB3Q9BUF7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB3Q9BUF7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB3Q9BUF7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRB3Q9BUF7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRB3Q9BUF7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRB3Q9BUF7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRB3Q9BUF7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRB3Q9BUF7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRB3Q9BUF7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CRB3Q9BUF7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRB3Q9BUF7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRB3Q9BUF7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRB3Q9BUF7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRB3Q9BUF7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRB3Q9BUF7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRB3Q9BUF7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRB3Q9BUF7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRB3Q9BUF7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRB3Q9BUF7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRB3Q9BUF7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRB3Q9BUF7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRB3Q9BUF7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRB3Q9BUF7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRB3Q9BUF7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRB3Q9BUF7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRB3Q9BUF7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRB3Q9BUF7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRB3Q9BUF7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRB3Q9BUF7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRB3Q9BUF7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRB3Q9BUF7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRB3Q9BUF7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRB3Q9BUF7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRB3Q9BUF7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms